Protein–RNA interactions for Protein: J3KMI7

Gm20828, MCG116667, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20828J3KMI7 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm20828J3KMI7 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm20828J3KMI7 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm20828J3KMI7 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm20828J3KMI7 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm20828J3KMI7 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm20828J3KMI7 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm20828J3KMI7 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm20828J3KMI7 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm20828J3KMI7 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm20828J3KMI7 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm20828J3KMI7 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm20828J3KMI7 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm20828J3KMI7 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm20828J3KMI7 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm20828J3KMI7 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm20828J3KMI7 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm20828J3KMI7 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm20828J3KMI7 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm20828J3KMI7 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm20828J3KMI7 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm20828J3KMI7 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm20828J3KMI7 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm20828J3KMI7 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm20828J3KMI7 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm20828J3KMI7 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm20828J3KMI7 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm20828J3KMI7 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm20828J3KMI7 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm20828J3KMI7 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm20828J3KMI7 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm20828J3KMI7 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm20828J3KMI7 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm20828J3KMI7 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm20828J3KMI7 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm20828J3KMI7 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm20828J3KMI7 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm20828J3KMI7 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm20828J3KMI7 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm20828J3KMI7 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm20828J3KMI7 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm20828J3KMI7 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm20828J3KMI7 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm20828J3KMI7 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm20828J3KMI7 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm20828J3KMI7 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm20828J3KMI7 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm20828J3KMI7 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm20828J3KMI7 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm20828J3KMI7 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm20828J3KMI7 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm20828J3KMI7 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm20828J3KMI7 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm20828J3KMI7 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm20828J3KMI7 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm20828J3KMI7 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm20828J3KMI7 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm20828J3KMI7 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm20828J3KMI7 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm20828J3KMI7 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm20828J3KMI7 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm20828J3KMI7 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm20828J3KMI7 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm20828J3KMI7 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm20828J3KMI7 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm20828J3KMI7 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm20828J3KMI7 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm20828J3KMI7 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm20828J3KMI7 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm20828J3KMI7 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm20828J3KMI7 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm20828J3KMI7 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm20828J3KMI7 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm20828J3KMI7 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm20828J3KMI7 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm20828J3KMI7 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm20828J3KMI7 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm20828J3KMI7 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
Gm20828J3KMI7 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gm20828J3KMI7 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gm20828J3KMI7 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gm20828J3KMI7 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm20828J3KMI7 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm20828J3KMI7 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm20828J3KMI7 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm20828J3KMI7 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm20828J3KMI7 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm20828J3KMI7 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm20828J3KMI7 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm20828J3KMI7 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm20828J3KMI7 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm20828J3KMI7 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm20828J3KMI7 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm20828J3KMI7 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm20828J3KMI7 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm20828J3KMI7 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm20828J3KMI7 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm20828J3KMI7 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm20828J3KMI7 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm20828J3KMI7 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms