Protein–RNA interactions for Protein: G3X9U3

Vmn1r58, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r58G3X9U3 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Vmn1r58G3X9U3 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Vmn1r58G3X9U3 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Vmn1r58G3X9U3 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Vmn1r58G3X9U3 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Vmn1r58G3X9U3 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Vmn1r58G3X9U3 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Vmn1r58G3X9U3 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Vmn1r58G3X9U3 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Vmn1r58G3X9U3 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Vmn1r58G3X9U3 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Vmn1r58G3X9U3 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Vmn1r58G3X9U3 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Vmn1r58G3X9U3 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Vmn1r58G3X9U3 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Vmn1r58G3X9U3 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Vmn1r58G3X9U3 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Vmn1r58G3X9U3 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Vmn1r58G3X9U3 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Vmn1r58G3X9U3 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Vmn1r58G3X9U3 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Vmn1r58G3X9U3 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Vmn1r58G3X9U3 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Vmn1r58G3X9U3 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Vmn1r58G3X9U3 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Vmn1r58G3X9U3 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Vmn1r58G3X9U3 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Vmn1r58G3X9U3 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Vmn1r58G3X9U3 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Vmn1r58G3X9U3 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Vmn1r58G3X9U3 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Vmn1r58G3X9U3 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Vmn1r58G3X9U3 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Vmn1r58G3X9U3 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Vmn1r58G3X9U3 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Vmn1r58G3X9U3 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Vmn1r58G3X9U3 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Vmn1r58G3X9U3 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Vmn1r58G3X9U3 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Vmn1r58G3X9U3 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Vmn1r58G3X9U3 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Vmn1r58G3X9U3 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Vmn1r58G3X9U3 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Vmn1r58G3X9U3 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Vmn1r58G3X9U3 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Vmn1r58G3X9U3 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Vmn1r58G3X9U3 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Vmn1r58G3X9U3 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Vmn1r58G3X9U3 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Vmn1r58G3X9U3 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Vmn1r58G3X9U3 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Vmn1r58G3X9U3 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Vmn1r58G3X9U3 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Vmn1r58G3X9U3 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Vmn1r58G3X9U3 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Vmn1r58G3X9U3 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Vmn1r58G3X9U3 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Vmn1r58G3X9U3 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Vmn1r58G3X9U3 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Vmn1r58G3X9U3 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Vmn1r58G3X9U3 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Vmn1r58G3X9U3 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Vmn1r58G3X9U3 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Vmn1r58G3X9U3 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
Vmn1r58G3X9U3 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Vmn1r58G3X9U3 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Vmn1r58G3X9U3 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Vmn1r58G3X9U3 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Vmn1r58G3X9U3 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Vmn1r58G3X9U3 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Vmn1r58G3X9U3 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Vmn1r58G3X9U3 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Vmn1r58G3X9U3 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Vmn1r58G3X9U3 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Vmn1r58G3X9U3 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Vmn1r58G3X9U3 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Vmn1r58G3X9U3 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Vmn1r58G3X9U3 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Vmn1r58G3X9U3 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Vmn1r58G3X9U3 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Vmn1r58G3X9U3 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Vmn1r58G3X9U3 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Vmn1r58G3X9U3 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Vmn1r58G3X9U3 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Vmn1r58G3X9U3 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Vmn1r58G3X9U3 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Vmn1r58G3X9U3 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Vmn1r58G3X9U3 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Vmn1r58G3X9U3 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Vmn1r58G3X9U3 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Vmn1r58G3X9U3 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Vmn1r58G3X9U3 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Vmn1r58G3X9U3 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Vmn1r58G3X9U3 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Vmn1r58G3X9U3 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Vmn1r58G3X9U3 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Vmn1r58G3X9U3 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Vmn1r58G3X9U3 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Vmn1r58G3X9U3 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Vmn1r58G3X9U3 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.6 ms