Protein–RNA interactions for Protein: G3UVU6

Gm20517, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 20, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20517G3UVU6 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm20517G3UVU6 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm20517G3UVU6 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm20517G3UVU6 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm20517G3UVU6 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm20517G3UVU6 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm20517G3UVU6 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm20517G3UVU6 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm20517G3UVU6 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm20517G3UVU6 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm20517G3UVU6 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm20517G3UVU6 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm20517G3UVU6 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm20517G3UVU6 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm20517G3UVU6 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm20517G3UVU6 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm20517G3UVU6 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm20517G3UVU6 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm20517G3UVU6 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm20517G3UVU6 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm20517G3UVU6 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm20517G3UVU6 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm20517G3UVU6 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm20517G3UVU6 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm20517G3UVU6 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm20517G3UVU6 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm20517G3UVU6 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm20517G3UVU6 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm20517G3UVU6 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm20517G3UVU6 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm20517G3UVU6 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm20517G3UVU6 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm20517G3UVU6 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm20517G3UVU6 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm20517G3UVU6 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm20517G3UVU6 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm20517G3UVU6 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm20517G3UVU6 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm20517G3UVU6 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm20517G3UVU6 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm20517G3UVU6 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm20517G3UVU6 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm20517G3UVU6 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm20517G3UVU6 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm20517G3UVU6 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm20517G3UVU6 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm20517G3UVU6 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm20517G3UVU6 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm20517G3UVU6 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm20517G3UVU6 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm20517G3UVU6 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm20517G3UVU6 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm20517G3UVU6 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm20517G3UVU6 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm20517G3UVU6 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm20517G3UVU6 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm20517G3UVU6 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm20517G3UVU6 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm20517G3UVU6 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm20517G3UVU6 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm20517G3UVU6 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm20517G3UVU6 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm20517G3UVU6 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm20517G3UVU6 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm20517G3UVU6 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm20517G3UVU6 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm20517G3UVU6 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm20517G3UVU6 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm20517G3UVU6 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm20517G3UVU6 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm20517G3UVU6 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm20517G3UVU6 AC129336.1-201ENSMUST00000220224 2277 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm20517G3UVU6 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm20517G3UVU6 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm20517G3UVU6 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm20517G3UVU6 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm20517G3UVU6 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm20517G3UVU6 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm20517G3UVU6 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm20517G3UVU6 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm20517G3UVU6 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm20517G3UVU6 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm20517G3UVU6 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm20517G3UVU6 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm20517G3UVU6 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm20517G3UVU6 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm20517G3UVU6 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm20517G3UVU6 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm20517G3UVU6 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm20517G3UVU6 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm20517G3UVU6 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm20517G3UVU6 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm20517G3UVU6 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm20517G3UVU6 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm20517G3UVU6 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm20517G3UVU6 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm20517G3UVU6 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm20517G3UVU6 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm20517G3UVU6 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm20517G3UVU6 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms