Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU6

Usp9y, Ubiquitin-specific peptidase 9, Y chromosome, mousemouse

Predictions only

Length 2,556 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9yF8VPU6 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Usp9yF8VPU6 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Usp9yF8VPU6 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Usp9yF8VPU6 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Usp9yF8VPU6 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Usp9yF8VPU6 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Usp9yF8VPU6 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Usp9yF8VPU6 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Usp9yF8VPU6 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Usp9yF8VPU6 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Usp9yF8VPU6 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Usp9yF8VPU6 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Usp9yF8VPU6 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Usp9yF8VPU6 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Usp9yF8VPU6 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Usp9yF8VPU6 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Usp9yF8VPU6 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Usp9yF8VPU6 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Usp9yF8VPU6 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Usp9yF8VPU6 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Usp9yF8VPU6 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Usp9yF8VPU6 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Usp9yF8VPU6 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Usp9yF8VPU6 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Usp9yF8VPU6 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Usp9yF8VPU6 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Usp9yF8VPU6 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Usp9yF8VPU6 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Usp9yF8VPU6 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Usp9yF8VPU6 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Usp9yF8VPU6 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Usp9yF8VPU6 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Usp9yF8VPU6 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Usp9yF8VPU6 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Usp9yF8VPU6 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Usp9yF8VPU6 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Usp9yF8VPU6 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Usp9yF8VPU6 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Usp9yF8VPU6 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Usp9yF8VPU6 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Usp9yF8VPU6 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Usp9yF8VPU6 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Usp9yF8VPU6 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Usp9yF8VPU6 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Usp9yF8VPU6 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Usp9yF8VPU6 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Usp9yF8VPU6 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Usp9yF8VPU6 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Usp9yF8VPU6 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Usp9yF8VPU6 Sumo2-203ENSMUST00000117589 987 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Usp9yF8VPU6 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Usp9yF8VPU6 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Usp9yF8VPU6 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Usp9yF8VPU6 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Usp9yF8VPU6 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Usp9yF8VPU6 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Usp9yF8VPU6 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Usp9yF8VPU6 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Usp9yF8VPU6 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Usp9yF8VPU6 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Usp9yF8VPU6 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Usp9yF8VPU6 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Usp9yF8VPU6 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Usp9yF8VPU6 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Usp9yF8VPU6 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Usp9yF8VPU6 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Usp9yF8VPU6 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Usp9yF8VPU6 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Usp9yF8VPU6 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Usp9yF8VPU6 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Usp9yF8VPU6 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Usp9yF8VPU6 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Usp9yF8VPU6 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Usp9yF8VPU6 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Usp9yF8VPU6 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Usp9yF8VPU6 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Usp9yF8VPU6 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Usp9yF8VPU6 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Usp9yF8VPU6 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Usp9yF8VPU6 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Usp9yF8VPU6 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Usp9yF8VPU6 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Usp9yF8VPU6 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Usp9yF8VPU6 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Usp9yF8VPU6 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Usp9yF8VPU6 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Usp9yF8VPU6 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Usp9yF8VPU6 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Usp9yF8VPU6 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Usp9yF8VPU6 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Usp9yF8VPU6 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Usp9yF8VPU6 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Usp9yF8VPU6 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Usp9yF8VPU6 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Usp9yF8VPU6 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Usp9yF8VPU6 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Usp9yF8VPU6 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Usp9yF8VPU6 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Usp9yF8VPU6 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Usp9yF8VPU6 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
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