Protein–RNA interactions for Protein: F6XWB2

Igkv1-99, Immunoglobulin kappa variable 1-99 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Igkv1-99F6XWB2 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Igkv1-99F6XWB2 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Igkv1-99F6XWB2 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Igkv1-99F6XWB2 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Igkv1-99F6XWB2 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Igkv1-99F6XWB2 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Igkv1-99F6XWB2 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Igkv1-99F6XWB2 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Igkv1-99F6XWB2 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Igkv1-99F6XWB2 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Igkv1-99F6XWB2 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Igkv1-99F6XWB2 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Igkv1-99F6XWB2 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Igkv1-99F6XWB2 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Igkv1-99F6XWB2 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Igkv1-99F6XWB2 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Igkv1-99F6XWB2 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Igkv1-99F6XWB2 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Igkv1-99F6XWB2 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Igkv1-99F6XWB2 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Igkv1-99F6XWB2 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Igkv1-99F6XWB2 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Igkv1-99F6XWB2 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Igkv1-99F6XWB2 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Igkv1-99F6XWB2 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Igkv1-99F6XWB2 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Igkv1-99F6XWB2 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Igkv1-99F6XWB2 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Igkv1-99F6XWB2 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Igkv1-99F6XWB2 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Igkv1-99F6XWB2 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Igkv1-99F6XWB2 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Igkv1-99F6XWB2 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Igkv1-99F6XWB2 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Igkv1-99F6XWB2 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Igkv1-99F6XWB2 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Igkv1-99F6XWB2 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Igkv1-99F6XWB2 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Igkv1-99F6XWB2 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Igkv1-99F6XWB2 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Igkv1-99F6XWB2 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Igkv1-99F6XWB2 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Igkv1-99F6XWB2 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Igkv1-99F6XWB2 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Igkv1-99F6XWB2 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Igkv1-99F6XWB2 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Igkv1-99F6XWB2 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Igkv1-99F6XWB2 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Igkv1-99F6XWB2 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Igkv1-99F6XWB2 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Igkv1-99F6XWB2 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Igkv1-99F6XWB2 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Igkv1-99F6XWB2 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Igkv1-99F6XWB2 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Igkv1-99F6XWB2 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Igkv1-99F6XWB2 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Igkv1-99F6XWB2 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Igkv1-99F6XWB2 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Igkv1-99F6XWB2 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Igkv1-99F6XWB2 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Igkv1-99F6XWB2 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Igkv1-99F6XWB2 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Igkv1-99F6XWB2 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Igkv1-99F6XWB2 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Igkv1-99F6XWB2 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Igkv1-99F6XWB2 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Igkv1-99F6XWB2 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Igkv1-99F6XWB2 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Igkv1-99F6XWB2 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Igkv1-99F6XWB2 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Igkv1-99F6XWB2 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Igkv1-99F6XWB2 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Igkv1-99F6XWB2 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Igkv1-99F6XWB2 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Igkv1-99F6XWB2 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Igkv1-99F6XWB2 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Igkv1-99F6XWB2 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Igkv1-99F6XWB2 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Igkv1-99F6XWB2 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Igkv1-99F6XWB2 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Igkv1-99F6XWB2 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Igkv1-99F6XWB2 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Igkv1-99F6XWB2 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Igkv1-99F6XWB2 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Igkv1-99F6XWB2 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Igkv1-99F6XWB2 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Igkv1-99F6XWB2 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Igkv1-99F6XWB2 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Igkv1-99F6XWB2 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Igkv1-99F6XWB2 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Igkv1-99F6XWB2 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Igkv1-99F6XWB2 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Igkv1-99F6XWB2 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Igkv1-99F6XWB2 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Igkv1-99F6XWB2 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Igkv1-99F6XWB2 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Igkv1-99F6XWB2 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Igkv1-99F6XWB2 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Igkv1-99F6XWB2 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Igkv1-99F6XWB2 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms