Protein–RNA interactions for Protein: F6U473

Gm28305, Predicted gene 28305 (Fragment), mousemouse

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Length 122 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28305F6U473 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm28305F6U473 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm28305F6U473 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm28305F6U473 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm28305F6U473 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm28305F6U473 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm28305F6U473 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm28305F6U473 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm28305F6U473 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm28305F6U473 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm28305F6U473 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm28305F6U473 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm28305F6U473 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm28305F6U473 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm28305F6U473 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm28305F6U473 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm28305F6U473 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm28305F6U473 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm28305F6U473 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm28305F6U473 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm28305F6U473 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm28305F6U473 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm28305F6U473 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm28305F6U473 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm28305F6U473 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm28305F6U473 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm28305F6U473 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm28305F6U473 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm28305F6U473 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm28305F6U473 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm28305F6U473 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm28305F6U473 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm28305F6U473 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm28305F6U473 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm28305F6U473 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm28305F6U473 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm28305F6U473 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm28305F6U473 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm28305F6U473 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm28305F6U473 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm28305F6U473 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm28305F6U473 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm28305F6U473 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm28305F6U473 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm28305F6U473 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm28305F6U473 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm28305F6U473 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm28305F6U473 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm28305F6U473 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm28305F6U473 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm28305F6U473 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm28305F6U473 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm28305F6U473 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm28305F6U473 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm28305F6U473 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm28305F6U473 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm28305F6U473 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm28305F6U473 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm28305F6U473 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm28305F6U473 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm28305F6U473 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
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Gm28305F6U473 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm28305F6U473 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
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Gm28305F6U473 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
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Gm28305F6U473 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm28305F6U473 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
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Gm28305F6U473 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
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Gm28305F6U473 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm28305F6U473 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm28305F6U473 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm28305F6U473 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm28305F6U473 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm28305F6U473 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm28305F6U473 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm28305F6U473 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm28305F6U473 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm28305F6U473 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm28305F6U473 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm28305F6U473 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm28305F6U473 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm28305F6U473 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm28305F6U473 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm28305F6U473 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gm28305F6U473 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gm28305F6U473 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gm28305F6U473 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC10.96□□□□□ -0.66
Gm28305F6U473 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gm28305F6U473 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gm28305F6U473 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gm28305F6U473 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gm28305F6U473 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gm28305F6U473 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gm28305F6U473 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm28305F6U473 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm28305F6U473 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
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