Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9Y3

Ccdc7b, Coiled-coil domain-containing 7B, mousemouse

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Length 381 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc7bE9Q9Y3 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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Ccdc7bE9Q9Y3 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc7bE9Q9Y3 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc7bE9Q9Y3 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc7bE9Q9Y3 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc7bE9Q9Y3 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc7bE9Q9Y3 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc7bE9Q9Y3 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc7bE9Q9Y3 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc7bE9Q9Y3 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc7bE9Q9Y3 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc7bE9Q9Y3 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc7bE9Q9Y3 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc7bE9Q9Y3 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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Ccdc7bE9Q9Y3 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc7bE9Q9Y3 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc7bE9Q9Y3 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccdc7bE9Q9Y3 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccdc7bE9Q9Y3 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccdc7bE9Q9Y3 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccdc7bE9Q9Y3 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccdc7bE9Q9Y3 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccdc7bE9Q9Y3 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccdc7bE9Q9Y3 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccdc7bE9Q9Y3 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccdc7bE9Q9Y3 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccdc7bE9Q9Y3 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccdc7bE9Q9Y3 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccdc7bE9Q9Y3 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccdc7bE9Q9Y3 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccdc7bE9Q9Y3 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
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Ccdc7bE9Q9Y3 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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Ccdc7bE9Q9Y3 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccdc7bE9Q9Y3 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccdc7bE9Q9Y3 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccdc7bE9Q9Y3 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccdc7bE9Q9Y3 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccdc7bE9Q9Y3 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccdc7bE9Q9Y3 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccdc7bE9Q9Y3 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccdc7bE9Q9Y3 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccdc7bE9Q9Y3 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccdc7bE9Q9Y3 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccdc7bE9Q9Y3 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccdc7bE9Q9Y3 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccdc7bE9Q9Y3 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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Ccdc7bE9Q9Y3 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ccdc7bE9Q9Y3 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ccdc7bE9Q9Y3 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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Ccdc7bE9Q9Y3 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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Ccdc7bE9Q9Y3 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ccdc7bE9Q9Y3 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ccdc7bE9Q9Y3 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ccdc7bE9Q9Y3 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ccdc7bE9Q9Y3 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ccdc7bE9Q9Y3 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ccdc7bE9Q9Y3 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ccdc7bE9Q9Y3 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ccdc7bE9Q9Y3 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ccdc7bE9Q9Y3 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ccdc7bE9Q9Y3 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ccdc7bE9Q9Y3 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc7bE9Q9Y3 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc7bE9Q9Y3 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc7bE9Q9Y3 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc7bE9Q9Y3 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc7bE9Q9Y3 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc7bE9Q9Y3 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc7bE9Q9Y3 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc7bE9Q9Y3 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc7bE9Q9Y3 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc7bE9Q9Y3 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc7bE9Q9Y3 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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Ccdc7bE9Q9Y3 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc7bE9Q9Y3 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc7bE9Q9Y3 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc7bE9Q9Y3 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms