Protein–RNA interactions for Protein: E9Q623

BC051665, cDNA sequence BC051665, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC051665E9Q623 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
BC051665E9Q623 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
BC051665E9Q623 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
BC051665E9Q623 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
BC051665E9Q623 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
BC051665E9Q623 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
BC051665E9Q623 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
BC051665E9Q623 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
BC051665E9Q623 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
BC051665E9Q623 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
BC051665E9Q623 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
BC051665E9Q623 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
BC051665E9Q623 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
BC051665E9Q623 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
BC051665E9Q623 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
BC051665E9Q623 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
BC051665E9Q623 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
BC051665E9Q623 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
BC051665E9Q623 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
BC051665E9Q623 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
BC051665E9Q623 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
BC051665E9Q623 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
BC051665E9Q623 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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BC051665E9Q623 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
BC051665E9Q623 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
BC051665E9Q623 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
BC051665E9Q623 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
BC051665E9Q623 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
BC051665E9Q623 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
BC051665E9Q623 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
BC051665E9Q623 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
BC051665E9Q623 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
BC051665E9Q623 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
BC051665E9Q623 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
BC051665E9Q623 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
BC051665E9Q623 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
BC051665E9Q623 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
BC051665E9Q623 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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BC051665E9Q623 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
BC051665E9Q623 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
BC051665E9Q623 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
BC051665E9Q623 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
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BC051665E9Q623 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
BC051665E9Q623 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
BC051665E9Q623 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
BC051665E9Q623 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
BC051665E9Q623 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
BC051665E9Q623 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
BC051665E9Q623 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
BC051665E9Q623 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
BC051665E9Q623 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
BC051665E9Q623 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
BC051665E9Q623 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
BC051665E9Q623 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
BC051665E9Q623 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
BC051665E9Q623 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
BC051665E9Q623 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
BC051665E9Q623 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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BC051665E9Q623 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
BC051665E9Q623 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
BC051665E9Q623 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
BC051665E9Q623 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
BC051665E9Q623 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
BC051665E9Q623 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
BC051665E9Q623 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
BC051665E9Q623 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
BC051665E9Q623 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
BC051665E9Q623 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
BC051665E9Q623 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
BC051665E9Q623 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
BC051665E9Q623 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
BC051665E9Q623 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
BC051665E9Q623 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
BC051665E9Q623 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
BC051665E9Q623 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
BC051665E9Q623 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
BC051665E9Q623 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
BC051665E9Q623 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
BC051665E9Q623 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
BC051665E9Q623 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
BC051665E9Q623 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
BC051665E9Q623 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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BC051665E9Q623 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
BC051665E9Q623 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
BC051665E9Q623 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
BC051665E9Q623 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
BC051665E9Q623 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
BC051665E9Q623 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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BC051665E9Q623 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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