Protein–RNA interactions for Protein: E9Q612

Ptpro, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, mousemouse

Predictions only

Length 1,226 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtproE9Q612 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PtproE9Q612 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PtproE9Q612 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PtproE9Q612 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PtproE9Q612 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PtproE9Q612 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PtproE9Q612 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PtproE9Q612 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PtproE9Q612 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PtproE9Q612 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PtproE9Q612 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PtproE9Q612 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PtproE9Q612 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PtproE9Q612 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PtproE9Q612 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PtproE9Q612 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PtproE9Q612 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PtproE9Q612 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PtproE9Q612 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PtproE9Q612 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PtproE9Q612 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PtproE9Q612 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PtproE9Q612 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PtproE9Q612 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PtproE9Q612 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PtproE9Q612 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PtproE9Q612 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PtproE9Q612 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PtproE9Q612 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PtproE9Q612 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PtproE9Q612 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PtproE9Q612 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PtproE9Q612 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PtproE9Q612 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PtproE9Q612 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PtproE9Q612 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PtproE9Q612 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PtproE9Q612 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PtproE9Q612 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PtproE9Q612 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PtproE9Q612 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PtproE9Q612 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PtproE9Q612 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PtproE9Q612 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PtproE9Q612 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PtproE9Q612 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PtproE9Q612 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PtproE9Q612 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PtproE9Q612 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PtproE9Q612 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PtproE9Q612 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PtproE9Q612 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PtproE9Q612 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PtproE9Q612 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PtproE9Q612 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PtproE9Q612 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PtproE9Q612 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PtproE9Q612 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PtproE9Q612 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PtproE9Q612 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PtproE9Q612 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PtproE9Q612 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PtproE9Q612 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PtproE9Q612 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PtproE9Q612 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PtproE9Q612 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PtproE9Q612 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PtproE9Q612 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PtproE9Q612 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PtproE9Q612 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PtproE9Q612 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PtproE9Q612 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PtproE9Q612 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PtproE9Q612 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PtproE9Q612 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PtproE9Q612 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PtproE9Q612 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PtproE9Q612 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PtproE9Q612 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PtproE9Q612 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PtproE9Q612 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PtproE9Q612 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PtproE9Q612 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PtproE9Q612 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PtproE9Q612 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PtproE9Q612 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PtproE9Q612 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PtproE9Q612 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PtproE9Q612 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PtproE9Q612 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PtproE9Q612 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PtproE9Q612 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PtproE9Q612 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PtproE9Q612 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PtproE9Q612 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PtproE9Q612 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PtproE9Q612 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PtproE9Q612 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PtproE9Q612 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PtproE9Q612 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms