Protein–RNA interactions for Protein: E9Q4T4

Ccdc71l, Coiled-coil domain-containing 71-like, mousemouse

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Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc71lE9Q4T4 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ccdc71lE9Q4T4 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ccdc71lE9Q4T4 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ccdc71lE9Q4T4 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ccdc71lE9Q4T4 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ccdc71lE9Q4T4 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ccdc71lE9Q4T4 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ccdc71lE9Q4T4 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ccdc71lE9Q4T4 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ccdc71lE9Q4T4 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Ccdc71lE9Q4T4 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ccdc71lE9Q4T4 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ccdc71lE9Q4T4 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ccdc71lE9Q4T4 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ccdc71lE9Q4T4 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ccdc71lE9Q4T4 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ccdc71lE9Q4T4 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ccdc71lE9Q4T4 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ccdc71lE9Q4T4 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ccdc71lE9Q4T4 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ccdc71lE9Q4T4 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ccdc71lE9Q4T4 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ccdc71lE9Q4T4 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ccdc71lE9Q4T4 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ccdc71lE9Q4T4 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ccdc71lE9Q4T4 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ccdc71lE9Q4T4 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ccdc71lE9Q4T4 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ccdc71lE9Q4T4 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ccdc71lE9Q4T4 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ccdc71lE9Q4T4 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ccdc71lE9Q4T4 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ccdc71lE9Q4T4 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ccdc71lE9Q4T4 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ccdc71lE9Q4T4 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ccdc71lE9Q4T4 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ccdc71lE9Q4T4 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ccdc71lE9Q4T4 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ccdc71lE9Q4T4 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ccdc71lE9Q4T4 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ccdc71lE9Q4T4 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ccdc71lE9Q4T4 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ccdc71lE9Q4T4 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ccdc71lE9Q4T4 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ccdc71lE9Q4T4 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ccdc71lE9Q4T4 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ccdc71lE9Q4T4 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ccdc71lE9Q4T4 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ccdc71lE9Q4T4 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ccdc71lE9Q4T4 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ccdc71lE9Q4T4 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ccdc71lE9Q4T4 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ccdc71lE9Q4T4 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ccdc71lE9Q4T4 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Ccdc71lE9Q4T4 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ccdc71lE9Q4T4 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ccdc71lE9Q4T4 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ccdc71lE9Q4T4 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccdc71lE9Q4T4 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccdc71lE9Q4T4 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccdc71lE9Q4T4 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccdc71lE9Q4T4 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccdc71lE9Q4T4 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccdc71lE9Q4T4 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccdc71lE9Q4T4 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccdc71lE9Q4T4 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccdc71lE9Q4T4 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccdc71lE9Q4T4 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccdc71lE9Q4T4 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccdc71lE9Q4T4 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccdc71lE9Q4T4 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccdc71lE9Q4T4 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccdc71lE9Q4T4 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccdc71lE9Q4T4 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccdc71lE9Q4T4 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccdc71lE9Q4T4 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccdc71lE9Q4T4 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccdc71lE9Q4T4 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccdc71lE9Q4T4 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccdc71lE9Q4T4 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccdc71lE9Q4T4 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccdc71lE9Q4T4 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccdc71lE9Q4T4 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccdc71lE9Q4T4 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccdc71lE9Q4T4 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccdc71lE9Q4T4 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccdc71lE9Q4T4 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccdc71lE9Q4T4 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccdc71lE9Q4T4 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccdc71lE9Q4T4 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccdc71lE9Q4T4 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccdc71lE9Q4T4 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccdc71lE9Q4T4 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccdc71lE9Q4T4 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccdc71lE9Q4T4 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccdc71lE9Q4T4 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccdc71lE9Q4T4 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccdc71lE9Q4T4 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccdc71lE9Q4T4 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccdc71lE9Q4T4 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
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