Protein–RNA interactions for Protein: E9Q058

Gm3095, Predicted gene 3095, mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3095E9Q058 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm3095E9Q058 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm3095E9Q058 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm3095E9Q058 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm3095E9Q058 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm3095E9Q058 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm3095E9Q058 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm3095E9Q058 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm3095E9Q058 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm3095E9Q058 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm3095E9Q058 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm3095E9Q058 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm3095E9Q058 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm3095E9Q058 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm3095E9Q058 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm3095E9Q058 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm3095E9Q058 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm3095E9Q058 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm3095E9Q058 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm3095E9Q058 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm3095E9Q058 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm3095E9Q058 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm3095E9Q058 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
Gm3095E9Q058 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Gm3095E9Q058 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm3095E9Q058 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm3095E9Q058 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm3095E9Q058 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm3095E9Q058 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm3095E9Q058 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm3095E9Q058 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm3095E9Q058 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm3095E9Q058 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm3095E9Q058 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm3095E9Q058 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm3095E9Q058 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm3095E9Q058 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm3095E9Q058 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm3095E9Q058 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm3095E9Q058 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm3095E9Q058 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm3095E9Q058 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm3095E9Q058 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm3095E9Q058 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm3095E9Q058 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm3095E9Q058 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm3095E9Q058 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm3095E9Q058 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm3095E9Q058 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm3095E9Q058 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm3095E9Q058 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm3095E9Q058 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm3095E9Q058 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm3095E9Q058 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm3095E9Q058 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm3095E9Q058 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm3095E9Q058 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm3095E9Q058 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm3095E9Q058 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm3095E9Q058 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm3095E9Q058 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm3095E9Q058 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm3095E9Q058 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm3095E9Q058 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm3095E9Q058 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm3095E9Q058 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm3095E9Q058 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm3095E9Q058 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm3095E9Q058 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm3095E9Q058 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm3095E9Q058 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm3095E9Q058 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm3095E9Q058 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm3095E9Q058 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm3095E9Q058 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm3095E9Q058 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm3095E9Q058 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm3095E9Q058 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm3095E9Q058 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm3095E9Q058 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm3095E9Q058 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm3095E9Q058 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm3095E9Q058 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm3095E9Q058 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm3095E9Q058 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm3095E9Q058 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm3095E9Q058 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm3095E9Q058 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm3095E9Q058 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm3095E9Q058 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm3095E9Q058 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm3095E9Q058 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm3095E9Q058 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm3095E9Q058 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm3095E9Q058 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm3095E9Q058 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm3095E9Q058 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm3095E9Q058 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm3095E9Q058 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm3095E9Q058 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms