Protein–RNA interactions for Protein: E9PXC0

Srp54b, Signal recognition particle 54 kDa protein, mousemouse

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Length 504 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp54bE9PXC0 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Srp54bE9PXC0 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Srp54bE9PXC0 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Srp54bE9PXC0 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Srp54bE9PXC0 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Srp54bE9PXC0 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Srp54bE9PXC0 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Srp54bE9PXC0 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Srp54bE9PXC0 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Srp54bE9PXC0 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Srp54bE9PXC0 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Srp54bE9PXC0 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Srp54bE9PXC0 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Srp54bE9PXC0 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Srp54bE9PXC0 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Srp54bE9PXC0 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Srp54bE9PXC0 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Srp54bE9PXC0 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Srp54bE9PXC0 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Srp54bE9PXC0 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Srp54bE9PXC0 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Srp54bE9PXC0 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Srp54bE9PXC0 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Srp54bE9PXC0 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Srp54bE9PXC0 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Srp54bE9PXC0 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Srp54bE9PXC0 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Srp54bE9PXC0 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Srp54bE9PXC0 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Srp54bE9PXC0 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Srp54bE9PXC0 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Srp54bE9PXC0 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Srp54bE9PXC0 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Srp54bE9PXC0 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Srp54bE9PXC0 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Srp54bE9PXC0 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Srp54bE9PXC0 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Srp54bE9PXC0 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Srp54bE9PXC0 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Srp54bE9PXC0 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Srp54bE9PXC0 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Srp54bE9PXC0 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Srp54bE9PXC0 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Srp54bE9PXC0 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Srp54bE9PXC0 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Srp54bE9PXC0 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Srp54bE9PXC0 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Srp54bE9PXC0 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Srp54bE9PXC0 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Srp54bE9PXC0 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Srp54bE9PXC0 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Srp54bE9PXC0 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Srp54bE9PXC0 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Srp54bE9PXC0 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Srp54bE9PXC0 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Srp54bE9PXC0 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Srp54bE9PXC0 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Srp54bE9PXC0 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Srp54bE9PXC0 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Srp54bE9PXC0 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Srp54bE9PXC0 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Srp54bE9PXC0 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Srp54bE9PXC0 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Srp54bE9PXC0 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Srp54bE9PXC0 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Srp54bE9PXC0 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Srp54bE9PXC0 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Srp54bE9PXC0 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Srp54bE9PXC0 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Srp54bE9PXC0 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Srp54bE9PXC0 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms