Protein–RNA interactions for Protein: E9PUT9

Gm3252, Predicted gene 3252, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3252E9PUT9 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm3252E9PUT9 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm3252E9PUT9 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm3252E9PUT9 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm3252E9PUT9 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm3252E9PUT9 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm3252E9PUT9 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm3252E9PUT9 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm3252E9PUT9 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm3252E9PUT9 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm3252E9PUT9 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm3252E9PUT9 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm3252E9PUT9 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm3252E9PUT9 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm3252E9PUT9 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm3252E9PUT9 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm3252E9PUT9 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm3252E9PUT9 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm3252E9PUT9 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm3252E9PUT9 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm3252E9PUT9 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm3252E9PUT9 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm3252E9PUT9 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm3252E9PUT9 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm3252E9PUT9 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm3252E9PUT9 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm3252E9PUT9 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm3252E9PUT9 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm3252E9PUT9 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm3252E9PUT9 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm3252E9PUT9 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm3252E9PUT9 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm3252E9PUT9 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm3252E9PUT9 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm3252E9PUT9 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm3252E9PUT9 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm3252E9PUT9 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm3252E9PUT9 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm3252E9PUT9 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm3252E9PUT9 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm3252E9PUT9 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm3252E9PUT9 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm3252E9PUT9 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm3252E9PUT9 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm3252E9PUT9 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm3252E9PUT9 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm3252E9PUT9 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm3252E9PUT9 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm3252E9PUT9 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm3252E9PUT9 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm3252E9PUT9 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm3252E9PUT9 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm3252E9PUT9 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm3252E9PUT9 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm3252E9PUT9 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm3252E9PUT9 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm3252E9PUT9 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm3252E9PUT9 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm3252E9PUT9 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm3252E9PUT9 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm3252E9PUT9 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm3252E9PUT9 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm3252E9PUT9 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm3252E9PUT9 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm3252E9PUT9 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm3252E9PUT9 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm3252E9PUT9 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm3252E9PUT9 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm3252E9PUT9 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm3252E9PUT9 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm3252E9PUT9 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm3252E9PUT9 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm3252E9PUT9 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm3252E9PUT9 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm3252E9PUT9 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm3252E9PUT9 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm3252E9PUT9 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm3252E9PUT9 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm3252E9PUT9 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm3252E9PUT9 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm3252E9PUT9 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm3252E9PUT9 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm3252E9PUT9 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm3252E9PUT9 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm3252E9PUT9 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm3252E9PUT9 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm3252E9PUT9 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm3252E9PUT9 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm3252E9PUT9 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm3252E9PUT9 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm3252E9PUT9 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm3252E9PUT9 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm3252E9PUT9 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm3252E9PUT9 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm3252E9PUT9 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm3252E9PUT9 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm3252E9PUT9 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm3252E9PUT9 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm3252E9PUT9 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm3252E9PUT9 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms