Protein–RNA interactions for Protein: E9PUL3

Clca3b, Chloride channel accessory 3B, mousemouse

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clca3bE9PUL3 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clca3bE9PUL3 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clca3bE9PUL3 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clca3bE9PUL3 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clca3bE9PUL3 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clca3bE9PUL3 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clca3bE9PUL3 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clca3bE9PUL3 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clca3bE9PUL3 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clca3bE9PUL3 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clca3bE9PUL3 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clca3bE9PUL3 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clca3bE9PUL3 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clca3bE9PUL3 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clca3bE9PUL3 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clca3bE9PUL3 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clca3bE9PUL3 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clca3bE9PUL3 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clca3bE9PUL3 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clca3bE9PUL3 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Clca3bE9PUL3 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Clca3bE9PUL3 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clca3bE9PUL3 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clca3bE9PUL3 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clca3bE9PUL3 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clca3bE9PUL3 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clca3bE9PUL3 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clca3bE9PUL3 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clca3bE9PUL3 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clca3bE9PUL3 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clca3bE9PUL3 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clca3bE9PUL3 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clca3bE9PUL3 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clca3bE9PUL3 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clca3bE9PUL3 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clca3bE9PUL3 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clca3bE9PUL3 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clca3bE9PUL3 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Clca3bE9PUL3 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Clca3bE9PUL3 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Clca3bE9PUL3 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Clca3bE9PUL3 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Clca3bE9PUL3 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Clca3bE9PUL3 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Clca3bE9PUL3 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Clca3bE9PUL3 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Clca3bE9PUL3 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Clca3bE9PUL3 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Clca3bE9PUL3 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Clca3bE9PUL3 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Clca3bE9PUL3 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Clca3bE9PUL3 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Clca3bE9PUL3 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Clca3bE9PUL3 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Clca3bE9PUL3 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Clca3bE9PUL3 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Clca3bE9PUL3 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Clca3bE9PUL3 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Clca3bE9PUL3 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Clca3bE9PUL3 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Clca3bE9PUL3 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Clca3bE9PUL3 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Clca3bE9PUL3 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clca3bE9PUL3 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clca3bE9PUL3 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clca3bE9PUL3 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clca3bE9PUL3 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clca3bE9PUL3 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clca3bE9PUL3 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clca3bE9PUL3 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clca3bE9PUL3 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clca3bE9PUL3 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Clca3bE9PUL3 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clca3bE9PUL3 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clca3bE9PUL3 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clca3bE9PUL3 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clca3bE9PUL3 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Clca3bE9PUL3 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clca3bE9PUL3 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Clca3bE9PUL3 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clca3bE9PUL3 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clca3bE9PUL3 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clca3bE9PUL3 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Clca3bE9PUL3 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Clca3bE9PUL3 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Clca3bE9PUL3 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Clca3bE9PUL3 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clca3bE9PUL3 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clca3bE9PUL3 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clca3bE9PUL3 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clca3bE9PUL3 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clca3bE9PUL3 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clca3bE9PUL3 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clca3bE9PUL3 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clca3bE9PUL3 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Clca3bE9PUL3 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clca3bE9PUL3 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clca3bE9PUL3 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clca3bE9PUL3 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clca3bE9PUL3 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms