Protein–RNA interactions for Protein: D3YUJ3

Ccnyl1, Cyclin Y-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnyl1D3YUJ3 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccnyl1D3YUJ3 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccnyl1D3YUJ3 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccnyl1D3YUJ3 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccnyl1D3YUJ3 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccnyl1D3YUJ3 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccnyl1D3YUJ3 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccnyl1D3YUJ3 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccnyl1D3YUJ3 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccnyl1D3YUJ3 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccnyl1D3YUJ3 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccnyl1D3YUJ3 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccnyl1D3YUJ3 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccnyl1D3YUJ3 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccnyl1D3YUJ3 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccnyl1D3YUJ3 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccnyl1D3YUJ3 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccnyl1D3YUJ3 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccnyl1D3YUJ3 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccnyl1D3YUJ3 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccnyl1D3YUJ3 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccnyl1D3YUJ3 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccnyl1D3YUJ3 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccnyl1D3YUJ3 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccnyl1D3YUJ3 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccnyl1D3YUJ3 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccnyl1D3YUJ3 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccnyl1D3YUJ3 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccnyl1D3YUJ3 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccnyl1D3YUJ3 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccnyl1D3YUJ3 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccnyl1D3YUJ3 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccnyl1D3YUJ3 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccnyl1D3YUJ3 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccnyl1D3YUJ3 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccnyl1D3YUJ3 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccnyl1D3YUJ3 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccnyl1D3YUJ3 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccnyl1D3YUJ3 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccnyl1D3YUJ3 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccnyl1D3YUJ3 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccnyl1D3YUJ3 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccnyl1D3YUJ3 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccnyl1D3YUJ3 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccnyl1D3YUJ3 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccnyl1D3YUJ3 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccnyl1D3YUJ3 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccnyl1D3YUJ3 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccnyl1D3YUJ3 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccnyl1D3YUJ3 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccnyl1D3YUJ3 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccnyl1D3YUJ3 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccnyl1D3YUJ3 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccnyl1D3YUJ3 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccnyl1D3YUJ3 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccnyl1D3YUJ3 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccnyl1D3YUJ3 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccnyl1D3YUJ3 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccnyl1D3YUJ3 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccnyl1D3YUJ3 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccnyl1D3YUJ3 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccnyl1D3YUJ3 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccnyl1D3YUJ3 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccnyl1D3YUJ3 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccnyl1D3YUJ3 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccnyl1D3YUJ3 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccnyl1D3YUJ3 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccnyl1D3YUJ3 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccnyl1D3YUJ3 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccnyl1D3YUJ3 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccnyl1D3YUJ3 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccnyl1D3YUJ3 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccnyl1D3YUJ3 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccnyl1D3YUJ3 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccnyl1D3YUJ3 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccnyl1D3YUJ3 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccnyl1D3YUJ3 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccnyl1D3YUJ3 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccnyl1D3YUJ3 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccnyl1D3YUJ3 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccnyl1D3YUJ3 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccnyl1D3YUJ3 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccnyl1D3YUJ3 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccnyl1D3YUJ3 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccnyl1D3YUJ3 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccnyl1D3YUJ3 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccnyl1D3YUJ3 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccnyl1D3YUJ3 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccnyl1D3YUJ3 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccnyl1D3YUJ3 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccnyl1D3YUJ3 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccnyl1D3YUJ3 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccnyl1D3YUJ3 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccnyl1D3YUJ3 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccnyl1D3YUJ3 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccnyl1D3YUJ3 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccnyl1D3YUJ3 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccnyl1D3YUJ3 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccnyl1D3YUJ3 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccnyl1D3YUJ3 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms