Protein–RNA interactions for Protein: B9EKE5

Catip, Ciliogenesis-associated TTC17-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CatipB9EKE5 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CatipB9EKE5 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CatipB9EKE5 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CatipB9EKE5 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CatipB9EKE5 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CatipB9EKE5 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CatipB9EKE5 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CatipB9EKE5 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CatipB9EKE5 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CatipB9EKE5 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CatipB9EKE5 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CatipB9EKE5 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CatipB9EKE5 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CatipB9EKE5 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CatipB9EKE5 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CatipB9EKE5 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CatipB9EKE5 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CatipB9EKE5 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CatipB9EKE5 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CatipB9EKE5 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CatipB9EKE5 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CatipB9EKE5 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CatipB9EKE5 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CatipB9EKE5 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CatipB9EKE5 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CatipB9EKE5 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CatipB9EKE5 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CatipB9EKE5 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CatipB9EKE5 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CatipB9EKE5 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CatipB9EKE5 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CatipB9EKE5 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CatipB9EKE5 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CatipB9EKE5 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CatipB9EKE5 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CatipB9EKE5 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CatipB9EKE5 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CatipB9EKE5 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CatipB9EKE5 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CatipB9EKE5 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CatipB9EKE5 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CatipB9EKE5 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CatipB9EKE5 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CatipB9EKE5 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CatipB9EKE5 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CatipB9EKE5 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CatipB9EKE5 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CatipB9EKE5 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CatipB9EKE5 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CatipB9EKE5 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CatipB9EKE5 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CatipB9EKE5 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CatipB9EKE5 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CatipB9EKE5 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CatipB9EKE5 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CatipB9EKE5 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CatipB9EKE5 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CatipB9EKE5 Gm25116-201ENSMUST00000157191 122 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CatipB9EKE5 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CatipB9EKE5 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CatipB9EKE5 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CatipB9EKE5 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CatipB9EKE5 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CatipB9EKE5 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CatipB9EKE5 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CatipB9EKE5 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CatipB9EKE5 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CatipB9EKE5 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CatipB9EKE5 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CatipB9EKE5 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CatipB9EKE5 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CatipB9EKE5 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CatipB9EKE5 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CatipB9EKE5 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CatipB9EKE5 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CatipB9EKE5 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CatipB9EKE5 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CatipB9EKE5 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CatipB9EKE5 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CatipB9EKE5 Gm13546-201ENSMUST00000135735 401 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CatipB9EKE5 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CatipB9EKE5 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CatipB9EKE5 Gm6991-201ENSMUST00000218475 1178 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CatipB9EKE5 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CatipB9EKE5 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CatipB9EKE5 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CatipB9EKE5 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CatipB9EKE5 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CatipB9EKE5 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CatipB9EKE5 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CatipB9EKE5 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CatipB9EKE5 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CatipB9EKE5 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CatipB9EKE5 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CatipB9EKE5 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CatipB9EKE5 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CatipB9EKE5 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
CatipB9EKE5 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CatipB9EKE5 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CatipB9EKE5 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms