Protein–RNA interactions for Protein: B2RUS7

Abcc8, ATP-binding cassette, sub-family C (CFTR/MRP), member 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc8B2RUS7 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Abcc8B2RUS7 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Abcc8B2RUS7 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Abcc8B2RUS7 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Abcc8B2RUS7 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Abcc8B2RUS7 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Abcc8B2RUS7 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Abcc8B2RUS7 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Abcc8B2RUS7 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Abcc8B2RUS7 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Abcc8B2RUS7 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
Abcc8B2RUS7 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
Abcc8B2RUS7 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Abcc8B2RUS7 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Abcc8B2RUS7 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Abcc8B2RUS7 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Abcc8B2RUS7 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Abcc8B2RUS7 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Abcc8B2RUS7 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Abcc8B2RUS7 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
Abcc8B2RUS7 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Abcc8B2RUS7 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
Abcc8B2RUS7 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Abcc8B2RUS7 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Abcc8B2RUS7 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Abcc8B2RUS7 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Abcc8B2RUS7 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Abcc8B2RUS7 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Abcc8B2RUS7 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
Abcc8B2RUS7 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Abcc8B2RUS7 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Abcc8B2RUS7 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Abcc8B2RUS7 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Abcc8B2RUS7 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
Abcc8B2RUS7 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
Abcc8B2RUS7 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Abcc8B2RUS7 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Abcc8B2RUS7 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Abcc8B2RUS7 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Abcc8B2RUS7 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
Abcc8B2RUS7 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
Abcc8B2RUS7 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
Abcc8B2RUS7 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC29.26■■■□□ 2.28
Abcc8B2RUS7 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
Abcc8B2RUS7 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.28
Abcc8B2RUS7 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC29.26■■■□□ 2.28
Abcc8B2RUS7 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
Abcc8B2RUS7 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.28
Abcc8B2RUS7 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC29.26■■■□□ 2.28
Abcc8B2RUS7 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.28
Abcc8B2RUS7 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Abcc8B2RUS7 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Abcc8B2RUS7 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Abcc8B2RUS7 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Abcc8B2RUS7 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Abcc8B2RUS7 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Abcc8B2RUS7 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Abcc8B2RUS7 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
Abcc8B2RUS7 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Abcc8B2RUS7 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Abcc8B2RUS7 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Abcc8B2RUS7 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Abcc8B2RUS7 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Abcc8B2RUS7 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Abcc8B2RUS7 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Abcc8B2RUS7 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Abcc8B2RUS7 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Abcc8B2RUS7 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Abcc8B2RUS7 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Abcc8B2RUS7 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Abcc8B2RUS7 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Abcc8B2RUS7 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Abcc8B2RUS7 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Abcc8B2RUS7 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Abcc8B2RUS7 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Abcc8B2RUS7 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Abcc8B2RUS7 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Abcc8B2RUS7 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Abcc8B2RUS7 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Abcc8B2RUS7 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Abcc8B2RUS7 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Abcc8B2RUS7 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
Abcc8B2RUS7 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
Abcc8B2RUS7 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Abcc8B2RUS7 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
Abcc8B2RUS7 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Abcc8B2RUS7 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Abcc8B2RUS7 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Abcc8B2RUS7 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Abcc8B2RUS7 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Abcc8B2RUS7 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Abcc8B2RUS7 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Abcc8B2RUS7 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Abcc8B2RUS7 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Abcc8B2RUS7 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Abcc8B2RUS7 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
Abcc8B2RUS7 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Abcc8B2RUS7 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
Abcc8B2RUS7 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Abcc8B2RUS7 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.5 ms