Protein–RNA interactions for Protein: A6X8Z9

4930435E12Rik, RIKEN cDNA 4930435E12 gene, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930435E12RikA6X8Z9 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
4930435E12RikA6X8Z9 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
4930435E12RikA6X8Z9 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
4930435E12RikA6X8Z9 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
4930435E12RikA6X8Z9 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
4930435E12RikA6X8Z9 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
4930435E12RikA6X8Z9 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
4930435E12RikA6X8Z9 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
4930435E12RikA6X8Z9 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
4930435E12RikA6X8Z9 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
4930435E12RikA6X8Z9 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
4930435E12RikA6X8Z9 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
4930435E12RikA6X8Z9 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
4930435E12RikA6X8Z9 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
4930435E12RikA6X8Z9 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
4930435E12RikA6X8Z9 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
4930435E12RikA6X8Z9 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
4930435E12RikA6X8Z9 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
4930435E12RikA6X8Z9 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
4930435E12RikA6X8Z9 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
4930435E12RikA6X8Z9 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
4930435E12RikA6X8Z9 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
4930435E12RikA6X8Z9 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
4930435E12RikA6X8Z9 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
4930435E12RikA6X8Z9 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
4930435E12RikA6X8Z9 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
4930435E12RikA6X8Z9 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
4930435E12RikA6X8Z9 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
4930435E12RikA6X8Z9 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
4930435E12RikA6X8Z9 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
4930435E12RikA6X8Z9 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
4930435E12RikA6X8Z9 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
4930435E12RikA6X8Z9 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
4930435E12RikA6X8Z9 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
4930435E12RikA6X8Z9 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
4930435E12RikA6X8Z9 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
4930435E12RikA6X8Z9 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
4930435E12RikA6X8Z9 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
4930435E12RikA6X8Z9 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
4930435E12RikA6X8Z9 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
4930435E12RikA6X8Z9 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
4930435E12RikA6X8Z9 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
4930435E12RikA6X8Z9 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
4930435E12RikA6X8Z9 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
4930435E12RikA6X8Z9 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
4930435E12RikA6X8Z9 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
4930435E12RikA6X8Z9 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
4930435E12RikA6X8Z9 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
4930435E12RikA6X8Z9 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
4930435E12RikA6X8Z9 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
4930435E12RikA6X8Z9 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
4930435E12RikA6X8Z9 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
4930435E12RikA6X8Z9 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
4930435E12RikA6X8Z9 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
4930435E12RikA6X8Z9 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
4930435E12RikA6X8Z9 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
4930435E12RikA6X8Z9 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
4930435E12RikA6X8Z9 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
4930435E12RikA6X8Z9 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
4930435E12RikA6X8Z9 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
4930435E12RikA6X8Z9 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
4930435E12RikA6X8Z9 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
4930435E12RikA6X8Z9 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
4930435E12RikA6X8Z9 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
4930435E12RikA6X8Z9 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
4930435E12RikA6X8Z9 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
4930435E12RikA6X8Z9 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
4930435E12RikA6X8Z9 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
4930435E12RikA6X8Z9 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
4930435E12RikA6X8Z9 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
4930435E12RikA6X8Z9 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
4930435E12RikA6X8Z9 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
4930435E12RikA6X8Z9 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
4930435E12RikA6X8Z9 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
4930435E12RikA6X8Z9 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
4930435E12RikA6X8Z9 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
4930435E12RikA6X8Z9 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
4930435E12RikA6X8Z9 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
4930435E12RikA6X8Z9 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
4930435E12RikA6X8Z9 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
4930435E12RikA6X8Z9 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
4930435E12RikA6X8Z9 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
4930435E12RikA6X8Z9 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
4930435E12RikA6X8Z9 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
4930435E12RikA6X8Z9 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
4930435E12RikA6X8Z9 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
4930435E12RikA6X8Z9 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
4930435E12RikA6X8Z9 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
4930435E12RikA6X8Z9 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
4930435E12RikA6X8Z9 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
4930435E12RikA6X8Z9 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
4930435E12RikA6X8Z9 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
4930435E12RikA6X8Z9 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
4930435E12RikA6X8Z9 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
4930435E12RikA6X8Z9 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
4930435E12RikA6X8Z9 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
4930435E12RikA6X8Z9 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
4930435E12RikA6X8Z9 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
4930435E12RikA6X8Z9 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
4930435E12RikA6X8Z9 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.2 ms