Protein–RNA interactions for Protein: A6PWV5

Arid3c, AT-rich interactive domain-containing protein 3C, mousemouse

Predictions only

Length 409 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arid3cA6PWV5 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Arid3cA6PWV5 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Arid3cA6PWV5 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Arid3cA6PWV5 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Arid3cA6PWV5 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Arid3cA6PWV5 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Arid3cA6PWV5 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Arid3cA6PWV5 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Arid3cA6PWV5 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Arid3cA6PWV5 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Arid3cA6PWV5 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Arid3cA6PWV5 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Arid3cA6PWV5 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Arid3cA6PWV5 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Arid3cA6PWV5 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Arid3cA6PWV5 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Arid3cA6PWV5 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Arid3cA6PWV5 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Arid3cA6PWV5 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Arid3cA6PWV5 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Arid3cA6PWV5 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Arid3cA6PWV5 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Arid3cA6PWV5 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Arid3cA6PWV5 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Arid3cA6PWV5 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Arid3cA6PWV5 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Arid3cA6PWV5 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Arid3cA6PWV5 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Arid3cA6PWV5 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Arid3cA6PWV5 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Arid3cA6PWV5 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Arid3cA6PWV5 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Arid3cA6PWV5 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Arid3cA6PWV5 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Arid3cA6PWV5 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Arid3cA6PWV5 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Arid3cA6PWV5 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Arid3cA6PWV5 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Arid3cA6PWV5 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Arid3cA6PWV5 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Arid3cA6PWV5 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Arid3cA6PWV5 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Arid3cA6PWV5 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Arid3cA6PWV5 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Arid3cA6PWV5 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Arid3cA6PWV5 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Arid3cA6PWV5 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Arid3cA6PWV5 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Arid3cA6PWV5 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Arid3cA6PWV5 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Arid3cA6PWV5 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Arid3cA6PWV5 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Arid3cA6PWV5 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Arid3cA6PWV5 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Arid3cA6PWV5 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Arid3cA6PWV5 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Arid3cA6PWV5 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Arid3cA6PWV5 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Arid3cA6PWV5 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Arid3cA6PWV5 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Arid3cA6PWV5 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Arid3cA6PWV5 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Arid3cA6PWV5 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Arid3cA6PWV5 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Arid3cA6PWV5 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Arid3cA6PWV5 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Arid3cA6PWV5 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Arid3cA6PWV5 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Arid3cA6PWV5 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Arid3cA6PWV5 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Arid3cA6PWV5 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Arid3cA6PWV5 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Arid3cA6PWV5 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Arid3cA6PWV5 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Arid3cA6PWV5 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Arid3cA6PWV5 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Arid3cA6PWV5 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Arid3cA6PWV5 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Arid3cA6PWV5 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Arid3cA6PWV5 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Arid3cA6PWV5 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Arid3cA6PWV5 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Arid3cA6PWV5 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Arid3cA6PWV5 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Arid3cA6PWV5 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Arid3cA6PWV5 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Arid3cA6PWV5 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Arid3cA6PWV5 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Arid3cA6PWV5 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Arid3cA6PWV5 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Arid3cA6PWV5 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Arid3cA6PWV5 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Arid3cA6PWV5 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Arid3cA6PWV5 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Arid3cA6PWV5 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Arid3cA6PWV5 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Arid3cA6PWV5 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Arid3cA6PWV5 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Arid3cA6PWV5 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Arid3cA6PWV5 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms