Protein–RNA interactions for Protein: A3FIN4

Atp8b5, Phospholipid-transporting ATPase FetA, mousemouse

Predictions only

Length 1,183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b5A3FIN4 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atp8b5A3FIN4 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atp8b5A3FIN4 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atp8b5A3FIN4 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Atp8b5A3FIN4 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atp8b5A3FIN4 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Atp8b5A3FIN4 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Atp8b5A3FIN4 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Atp8b5A3FIN4 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atp8b5A3FIN4 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atp8b5A3FIN4 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atp8b5A3FIN4 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atp8b5A3FIN4 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atp8b5A3FIN4 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atp8b5A3FIN4 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atp8b5A3FIN4 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atp8b5A3FIN4 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atp8b5A3FIN4 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atp8b5A3FIN4 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atp8b5A3FIN4 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atp8b5A3FIN4 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atp8b5A3FIN4 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atp8b5A3FIN4 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atp8b5A3FIN4 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atp8b5A3FIN4 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atp8b5A3FIN4 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atp8b5A3FIN4 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atp8b5A3FIN4 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atp8b5A3FIN4 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atp8b5A3FIN4 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atp8b5A3FIN4 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atp8b5A3FIN4 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atp8b5A3FIN4 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atp8b5A3FIN4 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atp8b5A3FIN4 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atp8b5A3FIN4 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Atp8b5A3FIN4 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atp8b5A3FIN4 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atp8b5A3FIN4 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atp8b5A3FIN4 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atp8b5A3FIN4 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atp8b5A3FIN4 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Atp8b5A3FIN4 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Atp8b5A3FIN4 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atp8b5A3FIN4 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atp8b5A3FIN4 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atp8b5A3FIN4 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atp8b5A3FIN4 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atp8b5A3FIN4 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atp8b5A3FIN4 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atp8b5A3FIN4 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atp8b5A3FIN4 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atp8b5A3FIN4 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atp8b5A3FIN4 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atp8b5A3FIN4 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atp8b5A3FIN4 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atp8b5A3FIN4 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atp8b5A3FIN4 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atp8b5A3FIN4 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atp8b5A3FIN4 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atp8b5A3FIN4 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atp8b5A3FIN4 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atp8b5A3FIN4 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atp8b5A3FIN4 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atp8b5A3FIN4 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atp8b5A3FIN4 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atp8b5A3FIN4 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atp8b5A3FIN4 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atp8b5A3FIN4 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atp8b5A3FIN4 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atp8b5A3FIN4 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atp8b5A3FIN4 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atp8b5A3FIN4 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atp8b5A3FIN4 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atp8b5A3FIN4 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atp8b5A3FIN4 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atp8b5A3FIN4 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atp8b5A3FIN4 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atp8b5A3FIN4 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atp8b5A3FIN4 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atp8b5A3FIN4 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atp8b5A3FIN4 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atp8b5A3FIN4 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atp8b5A3FIN4 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atp8b5A3FIN4 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atp8b5A3FIN4 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atp8b5A3FIN4 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atp8b5A3FIN4 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atp8b5A3FIN4 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atp8b5A3FIN4 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atp8b5A3FIN4 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atp8b5A3FIN4 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atp8b5A3FIN4 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Atp8b5A3FIN4 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atp8b5A3FIN4 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atp8b5A3FIN4 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Atp8b5A3FIN4 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atp8b5A3FIN4 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atp8b5A3FIN4 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atp8b5A3FIN4 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
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