Protein–RNA interactions for Protein: A2ASI5

Scn3a, Sodium channel protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,947 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn3aA2ASI5 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Scn3aA2ASI5 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Scn3aA2ASI5 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Scn3aA2ASI5 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Scn3aA2ASI5 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Scn3aA2ASI5 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Scn3aA2ASI5 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Scn3aA2ASI5 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Scn3aA2ASI5 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Scn3aA2ASI5 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Scn3aA2ASI5 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Scn3aA2ASI5 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Scn3aA2ASI5 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Scn3aA2ASI5 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Scn3aA2ASI5 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Scn3aA2ASI5 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Scn3aA2ASI5 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Scn3aA2ASI5 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Scn3aA2ASI5 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Scn3aA2ASI5 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Scn3aA2ASI5 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Scn3aA2ASI5 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Scn3aA2ASI5 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Scn3aA2ASI5 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Scn3aA2ASI5 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Scn3aA2ASI5 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Scn3aA2ASI5 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Scn3aA2ASI5 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Scn3aA2ASI5 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Scn3aA2ASI5 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Scn3aA2ASI5 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Scn3aA2ASI5 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Scn3aA2ASI5 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Scn3aA2ASI5 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Scn3aA2ASI5 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Scn3aA2ASI5 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Scn3aA2ASI5 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Scn3aA2ASI5 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Scn3aA2ASI5 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Scn3aA2ASI5 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Scn3aA2ASI5 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Scn3aA2ASI5 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Scn3aA2ASI5 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Scn3aA2ASI5 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Scn3aA2ASI5 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Scn3aA2ASI5 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Scn3aA2ASI5 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Scn3aA2ASI5 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Scn3aA2ASI5 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Scn3aA2ASI5 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Scn3aA2ASI5 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Scn3aA2ASI5 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Scn3aA2ASI5 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Scn3aA2ASI5 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Scn3aA2ASI5 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Scn3aA2ASI5 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Scn3aA2ASI5 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Scn3aA2ASI5 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Scn3aA2ASI5 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Scn3aA2ASI5 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Scn3aA2ASI5 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Scn3aA2ASI5 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Scn3aA2ASI5 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Scn3aA2ASI5 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Scn3aA2ASI5 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Scn3aA2ASI5 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Scn3aA2ASI5 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Scn3aA2ASI5 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Scn3aA2ASI5 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Scn3aA2ASI5 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Scn3aA2ASI5 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Scn3aA2ASI5 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Scn3aA2ASI5 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Scn3aA2ASI5 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Scn3aA2ASI5 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Scn3aA2ASI5 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Scn3aA2ASI5 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Scn3aA2ASI5 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Scn3aA2ASI5 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Scn3aA2ASI5 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Scn3aA2ASI5 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Scn3aA2ASI5 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Scn3aA2ASI5 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Scn3aA2ASI5 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Scn3aA2ASI5 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Scn3aA2ASI5 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Scn3aA2ASI5 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Scn3aA2ASI5 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Scn3aA2ASI5 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Scn3aA2ASI5 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Scn3aA2ASI5 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Scn3aA2ASI5 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Scn3aA2ASI5 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Scn3aA2ASI5 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Scn3aA2ASI5 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Scn3aA2ASI5 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Scn3aA2ASI5 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Scn3aA2ASI5 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Scn3aA2ASI5 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Scn3aA2ASI5 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms