Protein–RNA interactions for Protein: A2APC3

Ttll9, Probable tubulin polyglutamylase TTLL9, mousemouse

Predictions only

Length 461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttll9A2APC3 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ttll9A2APC3 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ttll9A2APC3 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ttll9A2APC3 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ttll9A2APC3 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ttll9A2APC3 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ttll9A2APC3 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ttll9A2APC3 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ttll9A2APC3 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ttll9A2APC3 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ttll9A2APC3 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ttll9A2APC3 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ttll9A2APC3 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ttll9A2APC3 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ttll9A2APC3 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ttll9A2APC3 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ttll9A2APC3 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ttll9A2APC3 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ttll9A2APC3 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Ttll9A2APC3 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ttll9A2APC3 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ttll9A2APC3 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ttll9A2APC3 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Ttll9A2APC3 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ttll9A2APC3 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ttll9A2APC3 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Ttll9A2APC3 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ttll9A2APC3 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Ttll9A2APC3 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Ttll9A2APC3 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Ttll9A2APC3 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ttll9A2APC3 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ttll9A2APC3 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ttll9A2APC3 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ttll9A2APC3 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ttll9A2APC3 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ttll9A2APC3 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ttll9A2APC3 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ttll9A2APC3 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ttll9A2APC3 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ttll9A2APC3 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ttll9A2APC3 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ttll9A2APC3 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ttll9A2APC3 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ttll9A2APC3 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ttll9A2APC3 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ttll9A2APC3 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ttll9A2APC3 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ttll9A2APC3 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ttll9A2APC3 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ttll9A2APC3 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ttll9A2APC3 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ttll9A2APC3 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ttll9A2APC3 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ttll9A2APC3 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ttll9A2APC3 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ttll9A2APC3 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ttll9A2APC3 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ttll9A2APC3 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ttll9A2APC3 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ttll9A2APC3 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ttll9A2APC3 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ttll9A2APC3 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ttll9A2APC3 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ttll9A2APC3 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ttll9A2APC3 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ttll9A2APC3 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ttll9A2APC3 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ttll9A2APC3 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ttll9A2APC3 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ttll9A2APC3 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ttll9A2APC3 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ttll9A2APC3 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ttll9A2APC3 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ttll9A2APC3 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ttll9A2APC3 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ttll9A2APC3 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ttll9A2APC3 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ttll9A2APC3 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ttll9A2APC3 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ttll9A2APC3 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ttll9A2APC3 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ttll9A2APC3 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ttll9A2APC3 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ttll9A2APC3 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Ttll9A2APC3 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ttll9A2APC3 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ttll9A2APC3 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ttll9A2APC3 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ttll9A2APC3 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ttll9A2APC3 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ttll9A2APC3 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ttll9A2APC3 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ttll9A2APC3 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ttll9A2APC3 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ttll9A2APC3 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ttll9A2APC3 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ttll9A2APC3 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ttll9A2APC3 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ttll9A2APC3 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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