Protein–RNA interactions for Protein: A2AJ77

Prdm12, PR domain zinc finger protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm12A2AJ77 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prdm12A2AJ77 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prdm12A2AJ77 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prdm12A2AJ77 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Prdm12A2AJ77 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Prdm12A2AJ77 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prdm12A2AJ77 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Prdm12A2AJ77 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prdm12A2AJ77 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prdm12A2AJ77 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prdm12A2AJ77 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prdm12A2AJ77 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Prdm12A2AJ77 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prdm12A2AJ77 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prdm12A2AJ77 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prdm12A2AJ77 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prdm12A2AJ77 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prdm12A2AJ77 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prdm12A2AJ77 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prdm12A2AJ77 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prdm12A2AJ77 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prdm12A2AJ77 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prdm12A2AJ77 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prdm12A2AJ77 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prdm12A2AJ77 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prdm12A2AJ77 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Prdm12A2AJ77 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prdm12A2AJ77 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prdm12A2AJ77 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prdm12A2AJ77 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prdm12A2AJ77 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prdm12A2AJ77 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prdm12A2AJ77 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prdm12A2AJ77 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prdm12A2AJ77 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prdm12A2AJ77 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prdm12A2AJ77 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Prdm12A2AJ77 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Prdm12A2AJ77 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prdm12A2AJ77 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Prdm12A2AJ77 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prdm12A2AJ77 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prdm12A2AJ77 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prdm12A2AJ77 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prdm12A2AJ77 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prdm12A2AJ77 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prdm12A2AJ77 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prdm12A2AJ77 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prdm12A2AJ77 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prdm12A2AJ77 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prdm12A2AJ77 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prdm12A2AJ77 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prdm12A2AJ77 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prdm12A2AJ77 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prdm12A2AJ77 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prdm12A2AJ77 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prdm12A2AJ77 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prdm12A2AJ77 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prdm12A2AJ77 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prdm12A2AJ77 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prdm12A2AJ77 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prdm12A2AJ77 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prdm12A2AJ77 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Prdm12A2AJ77 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prdm12A2AJ77 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prdm12A2AJ77 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prdm12A2AJ77 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prdm12A2AJ77 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prdm12A2AJ77 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prdm12A2AJ77 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prdm12A2AJ77 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prdm12A2AJ77 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prdm12A2AJ77 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prdm12A2AJ77 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prdm12A2AJ77 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prdm12A2AJ77 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prdm12A2AJ77 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prdm12A2AJ77 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prdm12A2AJ77 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prdm12A2AJ77 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prdm12A2AJ77 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prdm12A2AJ77 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prdm12A2AJ77 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prdm12A2AJ77 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prdm12A2AJ77 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prdm12A2AJ77 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prdm12A2AJ77 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prdm12A2AJ77 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prdm12A2AJ77 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prdm12A2AJ77 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prdm12A2AJ77 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prdm12A2AJ77 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prdm12A2AJ77 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Prdm12A2AJ77 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prdm12A2AJ77 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prdm12A2AJ77 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prdm12A2AJ77 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Prdm12A2AJ77 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prdm12A2AJ77 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prdm12A2AJ77 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms