Protein–RNA interactions for Protein: A2AFR3

Frmpd4, FERM and PDZ domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmpd4A2AFR3 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Frmpd4A2AFR3 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Frmpd4A2AFR3 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Frmpd4A2AFR3 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Frmpd4A2AFR3 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Frmpd4A2AFR3 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Frmpd4A2AFR3 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Frmpd4A2AFR3 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Frmpd4A2AFR3 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Frmpd4A2AFR3 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Frmpd4A2AFR3 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Frmpd4A2AFR3 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Frmpd4A2AFR3 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Frmpd4A2AFR3 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Frmpd4A2AFR3 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Frmpd4A2AFR3 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Frmpd4A2AFR3 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Frmpd4A2AFR3 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Frmpd4A2AFR3 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Frmpd4A2AFR3 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Frmpd4A2AFR3 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Frmpd4A2AFR3 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Frmpd4A2AFR3 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Frmpd4A2AFR3 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Frmpd4A2AFR3 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Frmpd4A2AFR3 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Frmpd4A2AFR3 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Frmpd4A2AFR3 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Frmpd4A2AFR3 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Frmpd4A2AFR3 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Frmpd4A2AFR3 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Frmpd4A2AFR3 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Frmpd4A2AFR3 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Frmpd4A2AFR3 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Frmpd4A2AFR3 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Frmpd4A2AFR3 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Frmpd4A2AFR3 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Frmpd4A2AFR3 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Frmpd4A2AFR3 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Frmpd4A2AFR3 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Frmpd4A2AFR3 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Frmpd4A2AFR3 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Frmpd4A2AFR3 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Frmpd4A2AFR3 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Frmpd4A2AFR3 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Frmpd4A2AFR3 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Frmpd4A2AFR3 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Frmpd4A2AFR3 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Frmpd4A2AFR3 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Frmpd4A2AFR3 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Frmpd4A2AFR3 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Frmpd4A2AFR3 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Frmpd4A2AFR3 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Frmpd4A2AFR3 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Frmpd4A2AFR3 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Frmpd4A2AFR3 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Frmpd4A2AFR3 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Frmpd4A2AFR3 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Frmpd4A2AFR3 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Frmpd4A2AFR3 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Frmpd4A2AFR3 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Frmpd4A2AFR3 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Frmpd4A2AFR3 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Frmpd4A2AFR3 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Frmpd4A2AFR3 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Frmpd4A2AFR3 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Frmpd4A2AFR3 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Frmpd4A2AFR3 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Frmpd4A2AFR3 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Frmpd4A2AFR3 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Frmpd4A2AFR3 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Frmpd4A2AFR3 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Frmpd4A2AFR3 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Frmpd4A2AFR3 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Frmpd4A2AFR3 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
Frmpd4A2AFR3 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
Frmpd4A2AFR3 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Frmpd4A2AFR3 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Frmpd4A2AFR3 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Frmpd4A2AFR3 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Frmpd4A2AFR3 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Frmpd4A2AFR3 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Frmpd4A2AFR3 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Frmpd4A2AFR3 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Frmpd4A2AFR3 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Frmpd4A2AFR3 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Frmpd4A2AFR3 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Frmpd4A2AFR3 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Frmpd4A2AFR3 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Frmpd4A2AFR3 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Frmpd4A2AFR3 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Frmpd4A2AFR3 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Frmpd4A2AFR3 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Frmpd4A2AFR3 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Frmpd4A2AFR3 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Frmpd4A2AFR3 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Frmpd4A2AFR3 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Frmpd4A2AFR3 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Frmpd4A2AFR3 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Frmpd4A2AFR3 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms