Protein–RNA interactions for Protein: A0N8N6

Trav12-2, T cell receptor alpha variable 12-2 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trav12-2A0N8N6 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trav12-2A0N8N6 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trav12-2A0N8N6 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trav12-2A0N8N6 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trav12-2A0N8N6 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Trav12-2A0N8N6 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trav12-2A0N8N6 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trav12-2A0N8N6 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trav12-2A0N8N6 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trav12-2A0N8N6 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Trav12-2A0N8N6 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trav12-2A0N8N6 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trav12-2A0N8N6 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trav12-2A0N8N6 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trav12-2A0N8N6 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trav12-2A0N8N6 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trav12-2A0N8N6 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trav12-2A0N8N6 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Trav12-2A0N8N6 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trav12-2A0N8N6 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trav12-2A0N8N6 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trav12-2A0N8N6 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trav12-2A0N8N6 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trav12-2A0N8N6 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trav12-2A0N8N6 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trav12-2A0N8N6 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trav12-2A0N8N6 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trav12-2A0N8N6 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trav12-2A0N8N6 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trav12-2A0N8N6 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trav12-2A0N8N6 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trav12-2A0N8N6 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Trav12-2A0N8N6 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trav12-2A0N8N6 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trav12-2A0N8N6 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trav12-2A0N8N6 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trav12-2A0N8N6 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Trav12-2A0N8N6 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trav12-2A0N8N6 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trav12-2A0N8N6 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Trav12-2A0N8N6 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trav12-2A0N8N6 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trav12-2A0N8N6 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trav12-2A0N8N6 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trav12-2A0N8N6 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trav12-2A0N8N6 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trav12-2A0N8N6 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trav12-2A0N8N6 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trav12-2A0N8N6 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trav12-2A0N8N6 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trav12-2A0N8N6 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trav12-2A0N8N6 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Trav12-2A0N8N6 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trav12-2A0N8N6 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trav12-2A0N8N6 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trav12-2A0N8N6 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trav12-2A0N8N6 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trav12-2A0N8N6 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trav12-2A0N8N6 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trav12-2A0N8N6 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trav12-2A0N8N6 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trav12-2A0N8N6 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trav12-2A0N8N6 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trav12-2A0N8N6 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trav12-2A0N8N6 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trav12-2A0N8N6 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trav12-2A0N8N6 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trav12-2A0N8N6 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trav12-2A0N8N6 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trav12-2A0N8N6 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trav12-2A0N8N6 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trav12-2A0N8N6 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Trav12-2A0N8N6 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Trav12-2A0N8N6 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trav12-2A0N8N6 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trav12-2A0N8N6 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trav12-2A0N8N6 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trav12-2A0N8N6 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trav12-2A0N8N6 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trav12-2A0N8N6 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trav12-2A0N8N6 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trav12-2A0N8N6 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trav12-2A0N8N6 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trav12-2A0N8N6 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trav12-2A0N8N6 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trav12-2A0N8N6 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trav12-2A0N8N6 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trav12-2A0N8N6 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trav12-2A0N8N6 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trav12-2A0N8N6 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trav12-2A0N8N6 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trav12-2A0N8N6 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trav12-2A0N8N6 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trav12-2A0N8N6 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trav12-2A0N8N6 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trav12-2A0N8N6 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trav12-2A0N8N6 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trav12-2A0N8N6 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trav12-2A0N8N6 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trav12-2A0N8N6 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms