Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SWI3

D6Ertd527e, DNA segment, Chr 6, ERATO Doi 527,-expressed, mousemouse

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Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC8.72□□□□□ -1.01
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC8.72□□□□□ -1.01
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC8.71□□□□□ -1.02
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.7□□□□□ -1.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.7□□□□□ -1.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC8.7□□□□□ -1.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC8.7□□□□□ -1.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
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