Protein–RNA interactions for Protein: V9GX38

Gm17190, Predicted gene 17190, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17190V9GX38 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm17190V9GX38 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm17190V9GX38 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm17190V9GX38 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm17190V9GX38 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm17190V9GX38 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm17190V9GX38 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm17190V9GX38 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm17190V9GX38 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm17190V9GX38 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm17190V9GX38 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm17190V9GX38 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm17190V9GX38 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm17190V9GX38 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm17190V9GX38 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm17190V9GX38 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm17190V9GX38 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm17190V9GX38 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm17190V9GX38 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm17190V9GX38 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm17190V9GX38 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm17190V9GX38 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm17190V9GX38 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm17190V9GX38 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm17190V9GX38 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm17190V9GX38 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm17190V9GX38 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm17190V9GX38 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm17190V9GX38 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm17190V9GX38 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm17190V9GX38 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm17190V9GX38 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm17190V9GX38 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm17190V9GX38 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm17190V9GX38 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm17190V9GX38 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm17190V9GX38 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm17190V9GX38 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm17190V9GX38 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm17190V9GX38 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm17190V9GX38 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm17190V9GX38 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm17190V9GX38 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm17190V9GX38 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm17190V9GX38 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm17190V9GX38 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm17190V9GX38 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm17190V9GX38 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm17190V9GX38 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm17190V9GX38 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm17190V9GX38 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm17190V9GX38 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm17190V9GX38 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm17190V9GX38 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm17190V9GX38 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm17190V9GX38 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm17190V9GX38 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm17190V9GX38 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm17190V9GX38 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm17190V9GX38 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm17190V9GX38 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm17190V9GX38 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm17190V9GX38 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm17190V9GX38 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm17190V9GX38 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm17190V9GX38 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm17190V9GX38 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm17190V9GX38 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm17190V9GX38 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm17190V9GX38 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm17190V9GX38 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm17190V9GX38 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm17190V9GX38 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm17190V9GX38 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm17190V9GX38 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm17190V9GX38 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm17190V9GX38 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm17190V9GX38 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm17190V9GX38 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm17190V9GX38 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm17190V9GX38 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm17190V9GX38 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm17190V9GX38 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm17190V9GX38 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm17190V9GX38 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm17190V9GX38 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm17190V9GX38 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm17190V9GX38 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm17190V9GX38 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm17190V9GX38 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm17190V9GX38 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm17190V9GX38 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm17190V9GX38 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm17190V9GX38 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm17190V9GX38 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm17190V9GX38 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm17190V9GX38 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm17190V9GX38 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm17190V9GX38 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm17190V9GX38 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms