Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z321

Top3b, DNA topoisomerase 3-beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 862 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top3bQ9Z321 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Top3bQ9Z321 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Top3bQ9Z321 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Top3bQ9Z321 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Top3bQ9Z321 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Top3bQ9Z321 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Top3bQ9Z321 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Top3bQ9Z321 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Top3bQ9Z321 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Top3bQ9Z321 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Top3bQ9Z321 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Top3bQ9Z321 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Top3bQ9Z321 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Top3bQ9Z321 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Top3bQ9Z321 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Top3bQ9Z321 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Top3bQ9Z321 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Top3bQ9Z321 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Top3bQ9Z321 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Top3bQ9Z321 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Top3bQ9Z321 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Top3bQ9Z321 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Top3bQ9Z321 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Top3bQ9Z321 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
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Top3bQ9Z321 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
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Top3bQ9Z321 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Top3bQ9Z321 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Top3bQ9Z321 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Top3bQ9Z321 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
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Top3bQ9Z321 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Top3bQ9Z321 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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Top3bQ9Z321 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Top3bQ9Z321 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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Top3bQ9Z321 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Top3bQ9Z321 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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Top3bQ9Z321 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Top3bQ9Z321 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Top3bQ9Z321 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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Top3bQ9Z321 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Top3bQ9Z321 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Top3bQ9Z321 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Top3bQ9Z321 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Top3bQ9Z321 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Top3bQ9Z321 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Top3bQ9Z321 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Top3bQ9Z321 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Top3bQ9Z321 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Top3bQ9Z321 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Top3bQ9Z321 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Top3bQ9Z321 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Top3bQ9Z321 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Top3bQ9Z321 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Top3bQ9Z321 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Top3bQ9Z321 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Top3bQ9Z321 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Top3bQ9Z321 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Top3bQ9Z321 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Top3bQ9Z321 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Top3bQ9Z321 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Top3bQ9Z321 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Top3bQ9Z321 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Top3bQ9Z321 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Top3bQ9Z321 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Top3bQ9Z321 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Top3bQ9Z321 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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