Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V9

Ccni, Cyclin-I, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcniQ9Z2V9 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
CcniQ9Z2V9 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CcniQ9Z2V9 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CcniQ9Z2V9 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CcniQ9Z2V9 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CcniQ9Z2V9 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CcniQ9Z2V9 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CcniQ9Z2V9 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CcniQ9Z2V9 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CcniQ9Z2V9 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CcniQ9Z2V9 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CcniQ9Z2V9 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CcniQ9Z2V9 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CcniQ9Z2V9 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CcniQ9Z2V9 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CcniQ9Z2V9 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CcniQ9Z2V9 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CcniQ9Z2V9 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CcniQ9Z2V9 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CcniQ9Z2V9 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
CcniQ9Z2V9 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CcniQ9Z2V9 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CcniQ9Z2V9 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CcniQ9Z2V9 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CcniQ9Z2V9 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CcniQ9Z2V9 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
CcniQ9Z2V9 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CcniQ9Z2V9 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
CcniQ9Z2V9 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CcniQ9Z2V9 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CcniQ9Z2V9 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CcniQ9Z2V9 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CcniQ9Z2V9 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CcniQ9Z2V9 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CcniQ9Z2V9 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CcniQ9Z2V9 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CcniQ9Z2V9 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CcniQ9Z2V9 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
CcniQ9Z2V9 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CcniQ9Z2V9 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CcniQ9Z2V9 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CcniQ9Z2V9 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
CcniQ9Z2V9 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CcniQ9Z2V9 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CcniQ9Z2V9 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CcniQ9Z2V9 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CcniQ9Z2V9 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CcniQ9Z2V9 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CcniQ9Z2V9 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CcniQ9Z2V9 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
CcniQ9Z2V9 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CcniQ9Z2V9 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CcniQ9Z2V9 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CcniQ9Z2V9 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CcniQ9Z2V9 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CcniQ9Z2V9 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CcniQ9Z2V9 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CcniQ9Z2V9 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CcniQ9Z2V9 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
CcniQ9Z2V9 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CcniQ9Z2V9 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CcniQ9Z2V9 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CcniQ9Z2V9 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CcniQ9Z2V9 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CcniQ9Z2V9 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CcniQ9Z2V9 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CcniQ9Z2V9 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CcniQ9Z2V9 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CcniQ9Z2V9 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CcniQ9Z2V9 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CcniQ9Z2V9 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CcniQ9Z2V9 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CcniQ9Z2V9 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CcniQ9Z2V9 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CcniQ9Z2V9 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CcniQ9Z2V9 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CcniQ9Z2V9 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CcniQ9Z2V9 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CcniQ9Z2V9 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CcniQ9Z2V9 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CcniQ9Z2V9 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
CcniQ9Z2V9 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
CcniQ9Z2V9 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
CcniQ9Z2V9 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CcniQ9Z2V9 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CcniQ9Z2V9 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CcniQ9Z2V9 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CcniQ9Z2V9 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CcniQ9Z2V9 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CcniQ9Z2V9 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CcniQ9Z2V9 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CcniQ9Z2V9 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CcniQ9Z2V9 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CcniQ9Z2V9 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CcniQ9Z2V9 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CcniQ9Z2V9 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CcniQ9Z2V9 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CcniQ9Z2V9 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CcniQ9Z2V9 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CcniQ9Z2V9 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms