Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2L7

Crlf3, Cytokine receptor-like factor 3, mousemouse

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Length 442 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crlf3Q9Z2L7 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Crlf3Q9Z2L7 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Crlf3Q9Z2L7 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Crlf3Q9Z2L7 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Crlf3Q9Z2L7 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Crlf3Q9Z2L7 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Crlf3Q9Z2L7 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Crlf3Q9Z2L7 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Crlf3Q9Z2L7 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Crlf3Q9Z2L7 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Crlf3Q9Z2L7 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Crlf3Q9Z2L7 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Crlf3Q9Z2L7 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Crlf3Q9Z2L7 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Crlf3Q9Z2L7 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Crlf3Q9Z2L7 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Crlf3Q9Z2L7 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Crlf3Q9Z2L7 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Crlf3Q9Z2L7 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Crlf3Q9Z2L7 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Crlf3Q9Z2L7 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Crlf3Q9Z2L7 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Crlf3Q9Z2L7 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Crlf3Q9Z2L7 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Crlf3Q9Z2L7 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Crlf3Q9Z2L7 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Crlf3Q9Z2L7 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Crlf3Q9Z2L7 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Crlf3Q9Z2L7 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Crlf3Q9Z2L7 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Crlf3Q9Z2L7 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Crlf3Q9Z2L7 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Crlf3Q9Z2L7 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Crlf3Q9Z2L7 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Crlf3Q9Z2L7 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Crlf3Q9Z2L7 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Crlf3Q9Z2L7 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Crlf3Q9Z2L7 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Crlf3Q9Z2L7 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Crlf3Q9Z2L7 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Crlf3Q9Z2L7 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Crlf3Q9Z2L7 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Crlf3Q9Z2L7 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Crlf3Q9Z2L7 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Crlf3Q9Z2L7 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Crlf3Q9Z2L7 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Crlf3Q9Z2L7 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Crlf3Q9Z2L7 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Crlf3Q9Z2L7 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Crlf3Q9Z2L7 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Crlf3Q9Z2L7 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Crlf3Q9Z2L7 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Crlf3Q9Z2L7 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Crlf3Q9Z2L7 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Crlf3Q9Z2L7 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Crlf3Q9Z2L7 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Crlf3Q9Z2L7 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Crlf3Q9Z2L7 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Crlf3Q9Z2L7 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Crlf3Q9Z2L7 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Crlf3Q9Z2L7 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Crlf3Q9Z2L7 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Crlf3Q9Z2L7 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Crlf3Q9Z2L7 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Crlf3Q9Z2L7 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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Crlf3Q9Z2L7 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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Crlf3Q9Z2L7 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Crlf3Q9Z2L7 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Crlf3Q9Z2L7 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Crlf3Q9Z2L7 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Crlf3Q9Z2L7 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Crlf3Q9Z2L7 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Crlf3Q9Z2L7 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Crlf3Q9Z2L7 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Crlf3Q9Z2L7 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Crlf3Q9Z2L7 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Crlf3Q9Z2L7 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Crlf3Q9Z2L7 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Crlf3Q9Z2L7 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Crlf3Q9Z2L7 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Crlf3Q9Z2L7 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Crlf3Q9Z2L7 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Crlf3Q9Z2L7 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Crlf3Q9Z2L7 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Crlf3Q9Z2L7 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Crlf3Q9Z2L7 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Crlf3Q9Z2L7 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Crlf3Q9Z2L7 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Crlf3Q9Z2L7 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Crlf3Q9Z2L7 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Crlf3Q9Z2L7 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Crlf3Q9Z2L7 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Crlf3Q9Z2L7 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Crlf3Q9Z2L7 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Crlf3Q9Z2L7 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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