Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2C5

Mtm1, Myotubularin, mousemouse

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Length 603 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mtm1Q9Z2C5 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mtm1Q9Z2C5 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mtm1Q9Z2C5 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mtm1Q9Z2C5 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mtm1Q9Z2C5 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mtm1Q9Z2C5 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mtm1Q9Z2C5 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mtm1Q9Z2C5 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mtm1Q9Z2C5 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mtm1Q9Z2C5 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mtm1Q9Z2C5 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mtm1Q9Z2C5 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mtm1Q9Z2C5 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mtm1Q9Z2C5 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mtm1Q9Z2C5 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mtm1Q9Z2C5 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mtm1Q9Z2C5 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Mtm1Q9Z2C5 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mtm1Q9Z2C5 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mtm1Q9Z2C5 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mtm1Q9Z2C5 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mtm1Q9Z2C5 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mtm1Q9Z2C5 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mtm1Q9Z2C5 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mtm1Q9Z2C5 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mtm1Q9Z2C5 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mtm1Q9Z2C5 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mtm1Q9Z2C5 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mtm1Q9Z2C5 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mtm1Q9Z2C5 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mtm1Q9Z2C5 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mtm1Q9Z2C5 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mtm1Q9Z2C5 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mtm1Q9Z2C5 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mtm1Q9Z2C5 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mtm1Q9Z2C5 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mtm1Q9Z2C5 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mtm1Q9Z2C5 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mtm1Q9Z2C5 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mtm1Q9Z2C5 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mtm1Q9Z2C5 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mtm1Q9Z2C5 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mtm1Q9Z2C5 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mtm1Q9Z2C5 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mtm1Q9Z2C5 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mtm1Q9Z2C5 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mtm1Q9Z2C5 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mtm1Q9Z2C5 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mtm1Q9Z2C5 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Mtm1Q9Z2C5 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mtm1Q9Z2C5 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mtm1Q9Z2C5 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mtm1Q9Z2C5 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mtm1Q9Z2C5 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mtm1Q9Z2C5 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mtm1Q9Z2C5 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Mtm1Q9Z2C5 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mtm1Q9Z2C5 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Mtm1Q9Z2C5 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mtm1Q9Z2C5 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mtm1Q9Z2C5 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mtm1Q9Z2C5 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mtm1Q9Z2C5 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mtm1Q9Z2C5 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mtm1Q9Z2C5 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mtm1Q9Z2C5 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mtm1Q9Z2C5 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mtm1Q9Z2C5 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Mtm1Q9Z2C5 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mtm1Q9Z2C5 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mtm1Q9Z2C5 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mtm1Q9Z2C5 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mtm1Q9Z2C5 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mtm1Q9Z2C5 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mtm1Q9Z2C5 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mtm1Q9Z2C5 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mtm1Q9Z2C5 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mtm1Q9Z2C5 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mtm1Q9Z2C5 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mtm1Q9Z2C5 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mtm1Q9Z2C5 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mtm1Q9Z2C5 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mtm1Q9Z2C5 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Mtm1Q9Z2C5 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mtm1Q9Z2C5 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mtm1Q9Z2C5 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mtm1Q9Z2C5 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms