Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z275

Rlbp1, Retinaldehyde-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rlbp1Q9Z275 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rlbp1Q9Z275 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rlbp1Q9Z275 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rlbp1Q9Z275 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rlbp1Q9Z275 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rlbp1Q9Z275 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rlbp1Q9Z275 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rlbp1Q9Z275 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rlbp1Q9Z275 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rlbp1Q9Z275 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Rlbp1Q9Z275 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rlbp1Q9Z275 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Rlbp1Q9Z275 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rlbp1Q9Z275 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rlbp1Q9Z275 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rlbp1Q9Z275 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rlbp1Q9Z275 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rlbp1Q9Z275 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rlbp1Q9Z275 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rlbp1Q9Z275 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rlbp1Q9Z275 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rlbp1Q9Z275 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rlbp1Q9Z275 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rlbp1Q9Z275 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rlbp1Q9Z275 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rlbp1Q9Z275 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rlbp1Q9Z275 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rlbp1Q9Z275 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rlbp1Q9Z275 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rlbp1Q9Z275 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rlbp1Q9Z275 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rlbp1Q9Z275 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rlbp1Q9Z275 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rlbp1Q9Z275 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rlbp1Q9Z275 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rlbp1Q9Z275 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rlbp1Q9Z275 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rlbp1Q9Z275 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rlbp1Q9Z275 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Rlbp1Q9Z275 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rlbp1Q9Z275 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Rlbp1Q9Z275 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rlbp1Q9Z275 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rlbp1Q9Z275 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rlbp1Q9Z275 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rlbp1Q9Z275 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rlbp1Q9Z275 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rlbp1Q9Z275 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rlbp1Q9Z275 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rlbp1Q9Z275 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rlbp1Q9Z275 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rlbp1Q9Z275 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rlbp1Q9Z275 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Rlbp1Q9Z275 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Rlbp1Q9Z275 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rlbp1Q9Z275 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rlbp1Q9Z275 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rlbp1Q9Z275 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rlbp1Q9Z275 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rlbp1Q9Z275 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Rlbp1Q9Z275 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rlbp1Q9Z275 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rlbp1Q9Z275 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Rlbp1Q9Z275 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rlbp1Q9Z275 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rlbp1Q9Z275 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rlbp1Q9Z275 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rlbp1Q9Z275 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rlbp1Q9Z275 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rlbp1Q9Z275 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rlbp1Q9Z275 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rlbp1Q9Z275 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rlbp1Q9Z275 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rlbp1Q9Z275 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rlbp1Q9Z275 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rlbp1Q9Z275 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rlbp1Q9Z275 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Rlbp1Q9Z275 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rlbp1Q9Z275 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rlbp1Q9Z275 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rlbp1Q9Z275 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rlbp1Q9Z275 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rlbp1Q9Z275 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rlbp1Q9Z275 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rlbp1Q9Z275 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rlbp1Q9Z275 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rlbp1Q9Z275 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rlbp1Q9Z275 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rlbp1Q9Z275 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rlbp1Q9Z275 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rlbp1Q9Z275 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rlbp1Q9Z275 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rlbp1Q9Z275 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rlbp1Q9Z275 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Rlbp1Q9Z275 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rlbp1Q9Z275 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rlbp1Q9Z275 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rlbp1Q9Z275 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rlbp1Q9Z275 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rlbp1Q9Z275 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms