Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1Z0

Uso1, General vesicular transport factor p115, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 959 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uso1Q9Z1Z0 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Uso1Q9Z1Z0 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Uso1Q9Z1Z0 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Uso1Q9Z1Z0 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Uso1Q9Z1Z0 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Uso1Q9Z1Z0 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Uso1Q9Z1Z0 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Uso1Q9Z1Z0 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Uso1Q9Z1Z0 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Uso1Q9Z1Z0 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Uso1Q9Z1Z0 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Uso1Q9Z1Z0 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Uso1Q9Z1Z0 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Uso1Q9Z1Z0 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Uso1Q9Z1Z0 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Uso1Q9Z1Z0 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Uso1Q9Z1Z0 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Uso1Q9Z1Z0 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Uso1Q9Z1Z0 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Uso1Q9Z1Z0 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Uso1Q9Z1Z0 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Uso1Q9Z1Z0 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Uso1Q9Z1Z0 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Uso1Q9Z1Z0 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Uso1Q9Z1Z0 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Uso1Q9Z1Z0 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Uso1Q9Z1Z0 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Uso1Q9Z1Z0 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Uso1Q9Z1Z0 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Uso1Q9Z1Z0 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Uso1Q9Z1Z0 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Uso1Q9Z1Z0 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Uso1Q9Z1Z0 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Uso1Q9Z1Z0 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Uso1Q9Z1Z0 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Uso1Q9Z1Z0 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Uso1Q9Z1Z0 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Uso1Q9Z1Z0 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Uso1Q9Z1Z0 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Uso1Q9Z1Z0 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Uso1Q9Z1Z0 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Uso1Q9Z1Z0 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Uso1Q9Z1Z0 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Uso1Q9Z1Z0 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Uso1Q9Z1Z0 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Uso1Q9Z1Z0 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Uso1Q9Z1Z0 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Uso1Q9Z1Z0 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Uso1Q9Z1Z0 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Uso1Q9Z1Z0 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Uso1Q9Z1Z0 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Uso1Q9Z1Z0 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Uso1Q9Z1Z0 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Uso1Q9Z1Z0 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Uso1Q9Z1Z0 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Uso1Q9Z1Z0 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Uso1Q9Z1Z0 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Uso1Q9Z1Z0 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Uso1Q9Z1Z0 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Uso1Q9Z1Z0 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Uso1Q9Z1Z0 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Uso1Q9Z1Z0 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Uso1Q9Z1Z0 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Uso1Q9Z1Z0 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Uso1Q9Z1Z0 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Uso1Q9Z1Z0 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Uso1Q9Z1Z0 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Uso1Q9Z1Z0 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Uso1Q9Z1Z0 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Uso1Q9Z1Z0 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Uso1Q9Z1Z0 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Uso1Q9Z1Z0 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Uso1Q9Z1Z0 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Uso1Q9Z1Z0 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Uso1Q9Z1Z0 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Uso1Q9Z1Z0 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Uso1Q9Z1Z0 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Uso1Q9Z1Z0 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Uso1Q9Z1Z0 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Uso1Q9Z1Z0 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Uso1Q9Z1Z0 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Uso1Q9Z1Z0 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Uso1Q9Z1Z0 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Uso1Q9Z1Z0 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Uso1Q9Z1Z0 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Uso1Q9Z1Z0 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Uso1Q9Z1Z0 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Uso1Q9Z1Z0 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Uso1Q9Z1Z0 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Uso1Q9Z1Z0 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Uso1Q9Z1Z0 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Uso1Q9Z1Z0 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Uso1Q9Z1Z0 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Uso1Q9Z1Z0 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Uso1Q9Z1Z0 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Uso1Q9Z1Z0 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Uso1Q9Z1Z0 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Uso1Q9Z1Z0 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Uso1Q9Z1Z0 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Uso1Q9Z1Z0 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.5 ms