Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1P4

Lgr5, Leucine-rich repeat-containing G-protein coupled receptor 5, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lgr5Q9Z1P4 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lgr5Q9Z1P4 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lgr5Q9Z1P4 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lgr5Q9Z1P4 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lgr5Q9Z1P4 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lgr5Q9Z1P4 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lgr5Q9Z1P4 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Lgr5Q9Z1P4 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
Lgr5Q9Z1P4 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Lgr5Q9Z1P4 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Lgr5Q9Z1P4 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Lgr5Q9Z1P4 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Lgr5Q9Z1P4 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lgr5Q9Z1P4 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lgr5Q9Z1P4 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lgr5Q9Z1P4 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lgr5Q9Z1P4 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lgr5Q9Z1P4 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lgr5Q9Z1P4 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lgr5Q9Z1P4 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lgr5Q9Z1P4 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lgr5Q9Z1P4 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lgr5Q9Z1P4 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lgr5Q9Z1P4 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lgr5Q9Z1P4 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Lgr5Q9Z1P4 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Lgr5Q9Z1P4 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lgr5Q9Z1P4 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lgr5Q9Z1P4 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lgr5Q9Z1P4 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lgr5Q9Z1P4 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lgr5Q9Z1P4 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lgr5Q9Z1P4 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lgr5Q9Z1P4 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lgr5Q9Z1P4 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lgr5Q9Z1P4 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lgr5Q9Z1P4 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Lgr5Q9Z1P4 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lgr5Q9Z1P4 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lgr5Q9Z1P4 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Lgr5Q9Z1P4 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lgr5Q9Z1P4 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lgr5Q9Z1P4 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Lgr5Q9Z1P4 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lgr5Q9Z1P4 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lgr5Q9Z1P4 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lgr5Q9Z1P4 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Lgr5Q9Z1P4 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Lgr5Q9Z1P4 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lgr5Q9Z1P4 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lgr5Q9Z1P4 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lgr5Q9Z1P4 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lgr5Q9Z1P4 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lgr5Q9Z1P4 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lgr5Q9Z1P4 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lgr5Q9Z1P4 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lgr5Q9Z1P4 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lgr5Q9Z1P4 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Lgr5Q9Z1P4 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lgr5Q9Z1P4 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lgr5Q9Z1P4 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lgr5Q9Z1P4 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lgr5Q9Z1P4 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lgr5Q9Z1P4 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lgr5Q9Z1P4 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lgr5Q9Z1P4 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lgr5Q9Z1P4 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lgr5Q9Z1P4 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lgr5Q9Z1P4 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lgr5Q9Z1P4 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lgr5Q9Z1P4 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lgr5Q9Z1P4 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Lgr5Q9Z1P4 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lgr5Q9Z1P4 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lgr5Q9Z1P4 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lgr5Q9Z1P4 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lgr5Q9Z1P4 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lgr5Q9Z1P4 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lgr5Q9Z1P4 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lgr5Q9Z1P4 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lgr5Q9Z1P4 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lgr5Q9Z1P4 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lgr5Q9Z1P4 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lgr5Q9Z1P4 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lgr5Q9Z1P4 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lgr5Q9Z1P4 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lgr5Q9Z1P4 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lgr5Q9Z1P4 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lgr5Q9Z1P4 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lgr5Q9Z1P4 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lgr5Q9Z1P4 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lgr5Q9Z1P4 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lgr5Q9Z1P4 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lgr5Q9Z1P4 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lgr5Q9Z1P4 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lgr5Q9Z1P4 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lgr5Q9Z1P4 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lgr5Q9Z1P4 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lgr5Q9Z1P4 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lgr5Q9Z1P4 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms