Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1J2

Nek4, Serine/threonine-protein kinase Nek4, mousemouse

Predictions only

Length 792 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek4Q9Z1J2 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Nek4Q9Z1J2 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nek4Q9Z1J2 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nek4Q9Z1J2 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nek4Q9Z1J2 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nek4Q9Z1J2 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nek4Q9Z1J2 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nek4Q9Z1J2 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nek4Q9Z1J2 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nek4Q9Z1J2 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nek4Q9Z1J2 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nek4Q9Z1J2 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nek4Q9Z1J2 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nek4Q9Z1J2 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nek4Q9Z1J2 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nek4Q9Z1J2 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nek4Q9Z1J2 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nek4Q9Z1J2 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nek4Q9Z1J2 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nek4Q9Z1J2 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Nek4Q9Z1J2 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nek4Q9Z1J2 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nek4Q9Z1J2 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nek4Q9Z1J2 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nek4Q9Z1J2 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nek4Q9Z1J2 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nek4Q9Z1J2 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nek4Q9Z1J2 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nek4Q9Z1J2 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nek4Q9Z1J2 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nek4Q9Z1J2 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nek4Q9Z1J2 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nek4Q9Z1J2 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nek4Q9Z1J2 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nek4Q9Z1J2 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nek4Q9Z1J2 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nek4Q9Z1J2 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nek4Q9Z1J2 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nek4Q9Z1J2 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nek4Q9Z1J2 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nek4Q9Z1J2 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nek4Q9Z1J2 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nek4Q9Z1J2 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nek4Q9Z1J2 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nek4Q9Z1J2 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nek4Q9Z1J2 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nek4Q9Z1J2 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nek4Q9Z1J2 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nek4Q9Z1J2 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nek4Q9Z1J2 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nek4Q9Z1J2 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nek4Q9Z1J2 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nek4Q9Z1J2 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nek4Q9Z1J2 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Nek4Q9Z1J2 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nek4Q9Z1J2 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nek4Q9Z1J2 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nek4Q9Z1J2 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nek4Q9Z1J2 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nek4Q9Z1J2 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nek4Q9Z1J2 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nek4Q9Z1J2 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nek4Q9Z1J2 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nek4Q9Z1J2 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nek4Q9Z1J2 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nek4Q9Z1J2 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nek4Q9Z1J2 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nek4Q9Z1J2 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nek4Q9Z1J2 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nek4Q9Z1J2 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nek4Q9Z1J2 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nek4Q9Z1J2 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nek4Q9Z1J2 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Nek4Q9Z1J2 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nek4Q9Z1J2 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nek4Q9Z1J2 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nek4Q9Z1J2 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Nek4Q9Z1J2 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Nek4Q9Z1J2 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nek4Q9Z1J2 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nek4Q9Z1J2 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nek4Q9Z1J2 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nek4Q9Z1J2 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nek4Q9Z1J2 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nek4Q9Z1J2 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nek4Q9Z1J2 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nek4Q9Z1J2 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nek4Q9Z1J2 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nek4Q9Z1J2 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nek4Q9Z1J2 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nek4Q9Z1J2 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nek4Q9Z1J2 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nek4Q9Z1J2 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nek4Q9Z1J2 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nek4Q9Z1J2 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nek4Q9Z1J2 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nek4Q9Z1J2 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nek4Q9Z1J2 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nek4Q9Z1J2 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nek4Q9Z1J2 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms