Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z160

Cog1, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 980 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cog1Q9Z160 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cog1Q9Z160 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cog1Q9Z160 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cog1Q9Z160 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Cog1Q9Z160 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cog1Q9Z160 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cog1Q9Z160 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cog1Q9Z160 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cog1Q9Z160 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cog1Q9Z160 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cog1Q9Z160 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cog1Q9Z160 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cog1Q9Z160 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cog1Q9Z160 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cog1Q9Z160 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cog1Q9Z160 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cog1Q9Z160 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cog1Q9Z160 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cog1Q9Z160 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cog1Q9Z160 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cog1Q9Z160 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Cog1Q9Z160 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cog1Q9Z160 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cog1Q9Z160 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cog1Q9Z160 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cog1Q9Z160 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cog1Q9Z160 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cog1Q9Z160 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cog1Q9Z160 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cog1Q9Z160 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cog1Q9Z160 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cog1Q9Z160 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cog1Q9Z160 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cog1Q9Z160 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cog1Q9Z160 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cog1Q9Z160 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cog1Q9Z160 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cog1Q9Z160 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Cog1Q9Z160 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cog1Q9Z160 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cog1Q9Z160 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cog1Q9Z160 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cog1Q9Z160 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cog1Q9Z160 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cog1Q9Z160 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cog1Q9Z160 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cog1Q9Z160 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cog1Q9Z160 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cog1Q9Z160 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cog1Q9Z160 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cog1Q9Z160 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cog1Q9Z160 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cog1Q9Z160 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cog1Q9Z160 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cog1Q9Z160 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cog1Q9Z160 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cog1Q9Z160 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cog1Q9Z160 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cog1Q9Z160 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cog1Q9Z160 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cog1Q9Z160 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cog1Q9Z160 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cog1Q9Z160 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cog1Q9Z160 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cog1Q9Z160 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cog1Q9Z160 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cog1Q9Z160 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cog1Q9Z160 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cog1Q9Z160 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cog1Q9Z160 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cog1Q9Z160 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cog1Q9Z160 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cog1Q9Z160 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cog1Q9Z160 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cog1Q9Z160 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cog1Q9Z160 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cog1Q9Z160 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Cog1Q9Z160 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cog1Q9Z160 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cog1Q9Z160 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cog1Q9Z160 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cog1Q9Z160 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cog1Q9Z160 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cog1Q9Z160 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cog1Q9Z160 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cog1Q9Z160 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cog1Q9Z160 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cog1Q9Z160 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cog1Q9Z160 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cog1Q9Z160 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cog1Q9Z160 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cog1Q9Z160 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cog1Q9Z160 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cog1Q9Z160 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cog1Q9Z160 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cog1Q9Z160 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cog1Q9Z160 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cog1Q9Z160 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cog1Q9Z160 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cog1Q9Z160 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83 ms