Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z123

Sema4f, Semaphorin-4F, mousemouse

Predictions only

Length 777 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema4fQ9Z123 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sema4fQ9Z123 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Sema4fQ9Z123 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sema4fQ9Z123 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sema4fQ9Z123 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Sema4fQ9Z123 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sema4fQ9Z123 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sema4fQ9Z123 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sema4fQ9Z123 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Sema4fQ9Z123 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sema4fQ9Z123 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sema4fQ9Z123 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Sema4fQ9Z123 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Sema4fQ9Z123 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sema4fQ9Z123 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sema4fQ9Z123 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sema4fQ9Z123 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sema4fQ9Z123 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Sema4fQ9Z123 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Sema4fQ9Z123 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sema4fQ9Z123 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Sema4fQ9Z123 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sema4fQ9Z123 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sema4fQ9Z123 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sema4fQ9Z123 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sema4fQ9Z123 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Sema4fQ9Z123 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Sema4fQ9Z123 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sema4fQ9Z123 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sema4fQ9Z123 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sema4fQ9Z123 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sema4fQ9Z123 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Sema4fQ9Z123 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sema4fQ9Z123 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Sema4fQ9Z123 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Sema4fQ9Z123 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Sema4fQ9Z123 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Sema4fQ9Z123 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sema4fQ9Z123 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sema4fQ9Z123 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Sema4fQ9Z123 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sema4fQ9Z123 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Sema4fQ9Z123 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Sema4fQ9Z123 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Sema4fQ9Z123 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Sema4fQ9Z123 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Sema4fQ9Z123 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Sema4fQ9Z123 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sema4fQ9Z123 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sema4fQ9Z123 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Sema4fQ9Z123 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sema4fQ9Z123 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sema4fQ9Z123 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sema4fQ9Z123 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Sema4fQ9Z123 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Sema4fQ9Z123 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sema4fQ9Z123 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sema4fQ9Z123 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sema4fQ9Z123 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sema4fQ9Z123 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sema4fQ9Z123 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Sema4fQ9Z123 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sema4fQ9Z123 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sema4fQ9Z123 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sema4fQ9Z123 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Sema4fQ9Z123 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Sema4fQ9Z123 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sema4fQ9Z123 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Sema4fQ9Z123 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Sema4fQ9Z123 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Sema4fQ9Z123 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sema4fQ9Z123 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sema4fQ9Z123 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sema4fQ9Z123 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sema4fQ9Z123 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Sema4fQ9Z123 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sema4fQ9Z123 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sema4fQ9Z123 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sema4fQ9Z123 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sema4fQ9Z123 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sema4fQ9Z123 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sema4fQ9Z123 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sema4fQ9Z123 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sema4fQ9Z123 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sema4fQ9Z123 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sema4fQ9Z123 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Sema4fQ9Z123 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sema4fQ9Z123 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sema4fQ9Z123 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sema4fQ9Z123 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sema4fQ9Z123 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Sema4fQ9Z123 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sema4fQ9Z123 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sema4fQ9Z123 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Sema4fQ9Z123 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Sema4fQ9Z123 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Sema4fQ9Z123 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Sema4fQ9Z123 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Sema4fQ9Z123 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Sema4fQ9Z123 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.7 ms