Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0S4

Cldn13, Claudin-13, mousemouse

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Length 211 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn13Q9Z0S4 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn13Q9Z0S4 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn13Q9Z0S4 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn13Q9Z0S4 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn13Q9Z0S4 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn13Q9Z0S4 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn13Q9Z0S4 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn13Q9Z0S4 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn13Q9Z0S4 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn13Q9Z0S4 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn13Q9Z0S4 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn13Q9Z0S4 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn13Q9Z0S4 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn13Q9Z0S4 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn13Q9Z0S4 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn13Q9Z0S4 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn13Q9Z0S4 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn13Q9Z0S4 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn13Q9Z0S4 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn13Q9Z0S4 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn13Q9Z0S4 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn13Q9Z0S4 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn13Q9Z0S4 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn13Q9Z0S4 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn13Q9Z0S4 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn13Q9Z0S4 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn13Q9Z0S4 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn13Q9Z0S4 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn13Q9Z0S4 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn13Q9Z0S4 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn13Q9Z0S4 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn13Q9Z0S4 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn13Q9Z0S4 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn13Q9Z0S4 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn13Q9Z0S4 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn13Q9Z0S4 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn13Q9Z0S4 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn13Q9Z0S4 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn13Q9Z0S4 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn13Q9Z0S4 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn13Q9Z0S4 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn13Q9Z0S4 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn13Q9Z0S4 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn13Q9Z0S4 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Cldn13Q9Z0S4 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn13Q9Z0S4 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn13Q9Z0S4 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn13Q9Z0S4 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn13Q9Z0S4 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn13Q9Z0S4 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn13Q9Z0S4 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn13Q9Z0S4 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn13Q9Z0S4 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn13Q9Z0S4 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn13Q9Z0S4 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn13Q9Z0S4 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn13Q9Z0S4 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn13Q9Z0S4 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn13Q9Z0S4 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn13Q9Z0S4 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn13Q9Z0S4 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn13Q9Z0S4 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn13Q9Z0S4 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn13Q9Z0S4 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn13Q9Z0S4 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn13Q9Z0S4 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn13Q9Z0S4 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn13Q9Z0S4 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn13Q9Z0S4 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn13Q9Z0S4 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn13Q9Z0S4 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn13Q9Z0S4 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn13Q9Z0S4 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn13Q9Z0S4 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn13Q9Z0S4 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn13Q9Z0S4 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn13Q9Z0S4 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn13Q9Z0S4 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn13Q9Z0S4 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn13Q9Z0S4 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn13Q9Z0S4 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn13Q9Z0S4 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn13Q9Z0S4 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn13Q9Z0S4 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn13Q9Z0S4 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn13Q9Z0S4 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn13Q9Z0S4 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn13Q9Z0S4 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn13Q9Z0S4 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn13Q9Z0S4 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn13Q9Z0S4 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn13Q9Z0S4 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn13Q9Z0S4 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn13Q9Z0S4 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn13Q9Z0S4 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn13Q9Z0S4 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn13Q9Z0S4 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn13Q9Z0S4 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn13Q9Z0S4 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn13Q9Z0S4 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.4 ms