Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0E3

Aire, Autoimmune regulator, mousemouse

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Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AireQ9Z0E3 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
AireQ9Z0E3 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
AireQ9Z0E3 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
AireQ9Z0E3 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
AireQ9Z0E3 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
AireQ9Z0E3 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
AireQ9Z0E3 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
AireQ9Z0E3 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
AireQ9Z0E3 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
AireQ9Z0E3 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
AireQ9Z0E3 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
AireQ9Z0E3 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
AireQ9Z0E3 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
AireQ9Z0E3 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
AireQ9Z0E3 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
AireQ9Z0E3 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
AireQ9Z0E3 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
AireQ9Z0E3 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
AireQ9Z0E3 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
AireQ9Z0E3 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
AireQ9Z0E3 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
AireQ9Z0E3 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
AireQ9Z0E3 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
AireQ9Z0E3 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
AireQ9Z0E3 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
AireQ9Z0E3 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
AireQ9Z0E3 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
AireQ9Z0E3 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
AireQ9Z0E3 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
AireQ9Z0E3 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
AireQ9Z0E3 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
AireQ9Z0E3 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
AireQ9Z0E3 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
AireQ9Z0E3 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
AireQ9Z0E3 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
AireQ9Z0E3 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
AireQ9Z0E3 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
AireQ9Z0E3 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
AireQ9Z0E3 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
AireQ9Z0E3 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
AireQ9Z0E3 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
AireQ9Z0E3 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
AireQ9Z0E3 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
AireQ9Z0E3 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
AireQ9Z0E3 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
AireQ9Z0E3 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
AireQ9Z0E3 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
AireQ9Z0E3 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
AireQ9Z0E3 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
AireQ9Z0E3 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
AireQ9Z0E3 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
AireQ9Z0E3 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
AireQ9Z0E3 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
AireQ9Z0E3 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
AireQ9Z0E3 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
AireQ9Z0E3 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
AireQ9Z0E3 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
AireQ9Z0E3 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
AireQ9Z0E3 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
AireQ9Z0E3 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
AireQ9Z0E3 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
AireQ9Z0E3 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
AireQ9Z0E3 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
AireQ9Z0E3 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
AireQ9Z0E3 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
AireQ9Z0E3 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
AireQ9Z0E3 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
AireQ9Z0E3 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
AireQ9Z0E3 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
AireQ9Z0E3 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
AireQ9Z0E3 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
AireQ9Z0E3 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
AireQ9Z0E3 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
AireQ9Z0E3 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
AireQ9Z0E3 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
AireQ9Z0E3 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
AireQ9Z0E3 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
AireQ9Z0E3 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
AireQ9Z0E3 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
AireQ9Z0E3 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
AireQ9Z0E3 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
AireQ9Z0E3 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
AireQ9Z0E3 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
AireQ9Z0E3 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
AireQ9Z0E3 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
AireQ9Z0E3 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
AireQ9Z0E3 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
AireQ9Z0E3 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
AireQ9Z0E3 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
AireQ9Z0E3 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
AireQ9Z0E3 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
AireQ9Z0E3 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
AireQ9Z0E3 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
AireQ9Z0E3 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
AireQ9Z0E3 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
AireQ9Z0E3 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
AireQ9Z0E3 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
AireQ9Z0E3 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
AireQ9Z0E3 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
AireQ9Z0E3 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
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