Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU38

Scnn1b, Amiloride-sensitive sodium channel subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scnn1bQ9WU38 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Scnn1bQ9WU38 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Scnn1bQ9WU38 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Scnn1bQ9WU38 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Scnn1bQ9WU38 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Scnn1bQ9WU38 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Scnn1bQ9WU38 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Scnn1bQ9WU38 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Scnn1bQ9WU38 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Scnn1bQ9WU38 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Scnn1bQ9WU38 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Scnn1bQ9WU38 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Scnn1bQ9WU38 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Scnn1bQ9WU38 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Scnn1bQ9WU38 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Scnn1bQ9WU38 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Scnn1bQ9WU38 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Scnn1bQ9WU38 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Scnn1bQ9WU38 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Scnn1bQ9WU38 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Scnn1bQ9WU38 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Scnn1bQ9WU38 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Scnn1bQ9WU38 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Scnn1bQ9WU38 Sox5it-201ENSMUST00000144026 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Scnn1bQ9WU38 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Scnn1bQ9WU38 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Scnn1bQ9WU38 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Scnn1bQ9WU38 Gm29013-201ENSMUST00000187431 237 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Scnn1bQ9WU38 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Scnn1bQ9WU38 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Scnn1bQ9WU38 AC138290.1-201ENSMUST00000219242 820 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Scnn1bQ9WU38 Il2-201ENSMUST00000029275 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Scnn1bQ9WU38 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Scnn1bQ9WU38 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Scnn1bQ9WU38 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Scnn1bQ9WU38 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Scnn1bQ9WU38 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Scnn1bQ9WU38 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Scnn1bQ9WU38 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Scnn1bQ9WU38 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Scnn1bQ9WU38 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Scnn1bQ9WU38 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Scnn1bQ9WU38 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Scnn1bQ9WU38 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Scnn1bQ9WU38 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Scnn1bQ9WU38 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Scnn1bQ9WU38 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Scnn1bQ9WU38 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Scnn1bQ9WU38 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Scnn1bQ9WU38 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Scnn1bQ9WU38 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Scnn1bQ9WU38 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Scnn1bQ9WU38 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Scnn1bQ9WU38 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Scnn1bQ9WU38 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Scnn1bQ9WU38 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Scnn1bQ9WU38 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Scnn1bQ9WU38 Gm43553-201ENSMUST00000200900 685 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Scnn1bQ9WU38 Gm45574-201ENSMUST00000210921 331 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Scnn1bQ9WU38 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Scnn1bQ9WU38 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Scnn1bQ9WU38 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Scnn1bQ9WU38 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Scnn1bQ9WU38 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Scnn1bQ9WU38 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Scnn1bQ9WU38 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Scnn1bQ9WU38 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Scnn1bQ9WU38 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Scnn1bQ9WU38 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Scnn1bQ9WU38 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Scnn1bQ9WU38 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Scnn1bQ9WU38 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Scnn1bQ9WU38 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Scnn1bQ9WU38 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Scnn1bQ9WU38 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Scnn1bQ9WU38 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Scnn1bQ9WU38 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Scnn1bQ9WU38 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Scnn1bQ9WU38 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Scnn1bQ9WU38 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Scnn1bQ9WU38 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Scnn1bQ9WU38 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scnn1bQ9WU38 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scnn1bQ9WU38 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scnn1bQ9WU38 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scnn1bQ9WU38 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scnn1bQ9WU38 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scnn1bQ9WU38 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scnn1bQ9WU38 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scnn1bQ9WU38 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scnn1bQ9WU38 Krcc1-201ENSMUST00000080949 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scnn1bQ9WU38 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scnn1bQ9WU38 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scnn1bQ9WU38 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scnn1bQ9WU38 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scnn1bQ9WU38 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scnn1bQ9WU38 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scnn1bQ9WU38 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scnn1bQ9WU38 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scnn1bQ9WU38 Gm17019-201ENSMUST00000167908 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms