Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1K7

Tubd1, Tubulin delta chain, mousemouse

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubd1Q9R1K7 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Tubd1Q9R1K7 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tubd1Q9R1K7 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Tubd1Q9R1K7 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tubd1Q9R1K7 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tubd1Q9R1K7 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Tubd1Q9R1K7 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tubd1Q9R1K7 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tubd1Q9R1K7 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tubd1Q9R1K7 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tubd1Q9R1K7 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tubd1Q9R1K7 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Tubd1Q9R1K7 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tubd1Q9R1K7 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tubd1Q9R1K7 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tubd1Q9R1K7 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tubd1Q9R1K7 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tubd1Q9R1K7 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tubd1Q9R1K7 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tubd1Q9R1K7 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tubd1Q9R1K7 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tubd1Q9R1K7 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tubd1Q9R1K7 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Tubd1Q9R1K7 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tubd1Q9R1K7 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tubd1Q9R1K7 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tubd1Q9R1K7 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tubd1Q9R1K7 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tubd1Q9R1K7 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Tubd1Q9R1K7 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tubd1Q9R1K7 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tubd1Q9R1K7 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tubd1Q9R1K7 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tubd1Q9R1K7 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tubd1Q9R1K7 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tubd1Q9R1K7 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tubd1Q9R1K7 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tubd1Q9R1K7 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tubd1Q9R1K7 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tubd1Q9R1K7 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tubd1Q9R1K7 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tubd1Q9R1K7 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tubd1Q9R1K7 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tubd1Q9R1K7 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tubd1Q9R1K7 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tubd1Q9R1K7 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tubd1Q9R1K7 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tubd1Q9R1K7 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Tubd1Q9R1K7 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tubd1Q9R1K7 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tubd1Q9R1K7 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tubd1Q9R1K7 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Tubd1Q9R1K7 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tubd1Q9R1K7 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tubd1Q9R1K7 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tubd1Q9R1K7 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tubd1Q9R1K7 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Tubd1Q9R1K7 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tubd1Q9R1K7 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tubd1Q9R1K7 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tubd1Q9R1K7 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tubd1Q9R1K7 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tubd1Q9R1K7 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tubd1Q9R1K7 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tubd1Q9R1K7 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tubd1Q9R1K7 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tubd1Q9R1K7 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tubd1Q9R1K7 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tubd1Q9R1K7 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tubd1Q9R1K7 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tubd1Q9R1K7 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tubd1Q9R1K7 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Tubd1Q9R1K7 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Tubd1Q9R1K7 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tubd1Q9R1K7 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tubd1Q9R1K7 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tubd1Q9R1K7 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tubd1Q9R1K7 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tubd1Q9R1K7 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tubd1Q9R1K7 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tubd1Q9R1K7 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tubd1Q9R1K7 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tubd1Q9R1K7 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tubd1Q9R1K7 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tubd1Q9R1K7 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Tubd1Q9R1K7 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Tubd1Q9R1K7 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tubd1Q9R1K7 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tubd1Q9R1K7 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tubd1Q9R1K7 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tubd1Q9R1K7 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tubd1Q9R1K7 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tubd1Q9R1K7 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tubd1Q9R1K7 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tubd1Q9R1K7 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tubd1Q9R1K7 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tubd1Q9R1K7 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tubd1Q9R1K7 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tubd1Q9R1K7 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tubd1Q9R1K7 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms