Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0L6

Pcm1, Pericentriolar material 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 2,025 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcm1Q9R0L6 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pcm1Q9R0L6 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pcm1Q9R0L6 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Pcm1Q9R0L6 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Pcm1Q9R0L6 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Pcm1Q9R0L6 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Pcm1Q9R0L6 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Pcm1Q9R0L6 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pcm1Q9R0L6 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pcm1Q9R0L6 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pcm1Q9R0L6 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pcm1Q9R0L6 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pcm1Q9R0L6 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pcm1Q9R0L6 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Pcm1Q9R0L6 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pcm1Q9R0L6 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pcm1Q9R0L6 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pcm1Q9R0L6 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pcm1Q9R0L6 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pcm1Q9R0L6 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pcm1Q9R0L6 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pcm1Q9R0L6 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pcm1Q9R0L6 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Pcm1Q9R0L6 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Pcm1Q9R0L6 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Pcm1Q9R0L6 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Pcm1Q9R0L6 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Pcm1Q9R0L6 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Pcm1Q9R0L6 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pcm1Q9R0L6 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pcm1Q9R0L6 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pcm1Q9R0L6 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pcm1Q9R0L6 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pcm1Q9R0L6 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pcm1Q9R0L6 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pcm1Q9R0L6 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pcm1Q9R0L6 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Pcm1Q9R0L6 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pcm1Q9R0L6 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Pcm1Q9R0L6 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pcm1Q9R0L6 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pcm1Q9R0L6 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pcm1Q9R0L6 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pcm1Q9R0L6 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Pcm1Q9R0L6 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pcm1Q9R0L6 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pcm1Q9R0L6 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pcm1Q9R0L6 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Pcm1Q9R0L6 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Pcm1Q9R0L6 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Pcm1Q9R0L6 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pcm1Q9R0L6 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pcm1Q9R0L6 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Pcm1Q9R0L6 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Pcm1Q9R0L6 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pcm1Q9R0L6 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Pcm1Q9R0L6 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pcm1Q9R0L6 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pcm1Q9R0L6 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pcm1Q9R0L6 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Pcm1Q9R0L6 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pcm1Q9R0L6 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pcm1Q9R0L6 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pcm1Q9R0L6 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pcm1Q9R0L6 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pcm1Q9R0L6 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pcm1Q9R0L6 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pcm1Q9R0L6 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pcm1Q9R0L6 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Pcm1Q9R0L6 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pcm1Q9R0L6 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pcm1Q9R0L6 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pcm1Q9R0L6 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pcm1Q9R0L6 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Pcm1Q9R0L6 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.03■□□□□ -0
Pcm1Q9R0L6 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.03■□□□□ -0
Pcm1Q9R0L6 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Pcm1Q9R0L6 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Pcm1Q9R0L6 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pcm1Q9R0L6 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Pcm1Q9R0L6 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pcm1Q9R0L6 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pcm1Q9R0L6 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Pcm1Q9R0L6 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pcm1Q9R0L6 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pcm1Q9R0L6 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pcm1Q9R0L6 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pcm1Q9R0L6 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pcm1Q9R0L6 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pcm1Q9R0L6 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pcm1Q9R0L6 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Pcm1Q9R0L6 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pcm1Q9R0L6 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pcm1Q9R0L6 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pcm1Q9R0L6 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Pcm1Q9R0L6 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pcm1Q9R0L6 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pcm1Q9R0L6 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pcm1Q9R0L6 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pcm1Q9R0L6 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms