Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0A5

Nek3, Serine/threonine-protein kinase Nek3, mousemouse

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Length 511 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek3Q9R0A5 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nek3Q9R0A5 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nek3Q9R0A5 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nek3Q9R0A5 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nek3Q9R0A5 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nek3Q9R0A5 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nek3Q9R0A5 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nek3Q9R0A5 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nek3Q9R0A5 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nek3Q9R0A5 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nek3Q9R0A5 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nek3Q9R0A5 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nek3Q9R0A5 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nek3Q9R0A5 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nek3Q9R0A5 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nek3Q9R0A5 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nek3Q9R0A5 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nek3Q9R0A5 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nek3Q9R0A5 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Nek3Q9R0A5 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nek3Q9R0A5 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nek3Q9R0A5 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nek3Q9R0A5 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nek3Q9R0A5 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nek3Q9R0A5 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Nek3Q9R0A5 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nek3Q9R0A5 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nek3Q9R0A5 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nek3Q9R0A5 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nek3Q9R0A5 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nek3Q9R0A5 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nek3Q9R0A5 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nek3Q9R0A5 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nek3Q9R0A5 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nek3Q9R0A5 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nek3Q9R0A5 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nek3Q9R0A5 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nek3Q9R0A5 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nek3Q9R0A5 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nek3Q9R0A5 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nek3Q9R0A5 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nek3Q9R0A5 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nek3Q9R0A5 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nek3Q9R0A5 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nek3Q9R0A5 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nek3Q9R0A5 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nek3Q9R0A5 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nek3Q9R0A5 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nek3Q9R0A5 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nek3Q9R0A5 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nek3Q9R0A5 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nek3Q9R0A5 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nek3Q9R0A5 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nek3Q9R0A5 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nek3Q9R0A5 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nek3Q9R0A5 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nek3Q9R0A5 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nek3Q9R0A5 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nek3Q9R0A5 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nek3Q9R0A5 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nek3Q9R0A5 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nek3Q9R0A5 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Nek3Q9R0A5 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nek3Q9R0A5 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nek3Q9R0A5 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nek3Q9R0A5 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nek3Q9R0A5 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Nek3Q9R0A5 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Nek3Q9R0A5 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
Nek3Q9R0A5 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Nek3Q9R0A5 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nek3Q9R0A5 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nek3Q9R0A5 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nek3Q9R0A5 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nek3Q9R0A5 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nek3Q9R0A5 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Nek3Q9R0A5 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nek3Q9R0A5 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nek3Q9R0A5 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nek3Q9R0A5 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nek3Q9R0A5 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nek3Q9R0A5 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nek3Q9R0A5 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Nek3Q9R0A5 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nek3Q9R0A5 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nek3Q9R0A5 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nek3Q9R0A5 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nek3Q9R0A5 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nek3Q9R0A5 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nek3Q9R0A5 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nek3Q9R0A5 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nek3Q9R0A5 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nek3Q9R0A5 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nek3Q9R0A5 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nek3Q9R0A5 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nek3Q9R0A5 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nek3Q9R0A5 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nek3Q9R0A5 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nek3Q9R0A5 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Nek3Q9R0A5 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
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