Protein–RNA interactions for Protein: Q9R087

Gpc6, Glypican-6, mousemouse

Predictions only

Length 555 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc6Q9R087 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gpc6Q9R087 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gpc6Q9R087 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
Gpc6Q9R087 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gpc6Q9R087 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Gpc6Q9R087 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gpc6Q9R087 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Gpc6Q9R087 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
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Gpc6Q9R087 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Gpc6Q9R087 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gpc6Q9R087 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
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Gpc6Q9R087 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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Gpc6Q9R087 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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Gpc6Q9R087 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gpc6Q9R087 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gpc6Q9R087 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
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Gpc6Q9R087 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gpc6Q9R087 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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Gpc6Q9R087 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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Gpc6Q9R087 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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Gpc6Q9R087 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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Gpc6Q9R087 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gpc6Q9R087 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gpc6Q9R087 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
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Gpc6Q9R087 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
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Gpc6Q9R087 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gpc6Q9R087 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gpc6Q9R087 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gpc6Q9R087 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gpc6Q9R087 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gpc6Q9R087 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gpc6Q9R087 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gpc6Q9R087 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gpc6Q9R087 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gpc6Q9R087 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gpc6Q9R087 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Gpc6Q9R087 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Gpc6Q9R087 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Gpc6Q9R087 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Gpc6Q9R087 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Gpc6Q9R087 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gpc6Q9R087 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
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