Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS8

Sh2d3c, SH2 domain-containing protein 3C, mousemouse

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Length 854 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh2d3cQ9QZS8 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sh2d3cQ9QZS8 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sh2d3cQ9QZS8 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sh2d3cQ9QZS8 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sh2d3cQ9QZS8 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sh2d3cQ9QZS8 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sh2d3cQ9QZS8 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sh2d3cQ9QZS8 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sh2d3cQ9QZS8 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sh2d3cQ9QZS8 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sh2d3cQ9QZS8 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sh2d3cQ9QZS8 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Sh2d3cQ9QZS8 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sh2d3cQ9QZS8 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sh2d3cQ9QZS8 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sh2d3cQ9QZS8 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sh2d3cQ9QZS8 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sh2d3cQ9QZS8 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sh2d3cQ9QZS8 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sh2d3cQ9QZS8 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sh2d3cQ9QZS8 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sh2d3cQ9QZS8 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sh2d3cQ9QZS8 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Sh2d3cQ9QZS8 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sh2d3cQ9QZS8 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sh2d3cQ9QZS8 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sh2d3cQ9QZS8 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sh2d3cQ9QZS8 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sh2d3cQ9QZS8 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sh2d3cQ9QZS8 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sh2d3cQ9QZS8 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Sh2d3cQ9QZS8 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sh2d3cQ9QZS8 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sh2d3cQ9QZS8 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sh2d3cQ9QZS8 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sh2d3cQ9QZS8 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sh2d3cQ9QZS8 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sh2d3cQ9QZS8 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sh2d3cQ9QZS8 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sh2d3cQ9QZS8 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sh2d3cQ9QZS8 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sh2d3cQ9QZS8 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sh2d3cQ9QZS8 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sh2d3cQ9QZS8 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sh2d3cQ9QZS8 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sh2d3cQ9QZS8 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sh2d3cQ9QZS8 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Sh2d3cQ9QZS8 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sh2d3cQ9QZS8 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sh2d3cQ9QZS8 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sh2d3cQ9QZS8 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sh2d3cQ9QZS8 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sh2d3cQ9QZS8 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sh2d3cQ9QZS8 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Sh2d3cQ9QZS8 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sh2d3cQ9QZS8 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sh2d3cQ9QZS8 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sh2d3cQ9QZS8 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sh2d3cQ9QZS8 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sh2d3cQ9QZS8 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sh2d3cQ9QZS8 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sh2d3cQ9QZS8 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sh2d3cQ9QZS8 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sh2d3cQ9QZS8 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sh2d3cQ9QZS8 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sh2d3cQ9QZS8 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sh2d3cQ9QZS8 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Sh2d3cQ9QZS8 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Sh2d3cQ9QZS8 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Sh2d3cQ9QZS8 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sh2d3cQ9QZS8 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Sh2d3cQ9QZS8 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Sh2d3cQ9QZS8 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sh2d3cQ9QZS8 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sh2d3cQ9QZS8 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sh2d3cQ9QZS8 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sh2d3cQ9QZS8 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sh2d3cQ9QZS8 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sh2d3cQ9QZS8 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sh2d3cQ9QZS8 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sh2d3cQ9QZS8 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sh2d3cQ9QZS8 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sh2d3cQ9QZS8 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sh2d3cQ9QZS8 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sh2d3cQ9QZS8 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sh2d3cQ9QZS8 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sh2d3cQ9QZS8 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sh2d3cQ9QZS8 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sh2d3cQ9QZS8 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sh2d3cQ9QZS8 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sh2d3cQ9QZS8 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sh2d3cQ9QZS8 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sh2d3cQ9QZS8 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sh2d3cQ9QZS8 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sh2d3cQ9QZS8 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Sh2d3cQ9QZS8 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
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