Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZR0

Rnf25, E3 ubiquitin-protein ligase RNF25, mousemouse

Predictions only

Length 456 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf25Q9QZR0 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnf25Q9QZR0 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnf25Q9QZR0 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnf25Q9QZR0 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnf25Q9QZR0 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnf25Q9QZR0 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnf25Q9QZR0 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnf25Q9QZR0 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnf25Q9QZR0 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnf25Q9QZR0 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf25Q9QZR0 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf25Q9QZR0 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf25Q9QZR0 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf25Q9QZR0 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf25Q9QZR0 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf25Q9QZR0 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf25Q9QZR0 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf25Q9QZR0 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf25Q9QZR0 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf25Q9QZR0 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf25Q9QZR0 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf25Q9QZR0 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf25Q9QZR0 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf25Q9QZR0 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf25Q9QZR0 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf25Q9QZR0 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf25Q9QZR0 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf25Q9QZR0 Gm3139-202ENSMUST00000201138 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf25Q9QZR0 Gm3183-203ENSMUST00000202911 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf25Q9QZR0 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf25Q9QZR0 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf25Q9QZR0 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf25Q9QZR0 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf25Q9QZR0 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf25Q9QZR0 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf25Q9QZR0 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf25Q9QZR0 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf25Q9QZR0 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf25Q9QZR0 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf25Q9QZR0 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf25Q9QZR0 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf25Q9QZR0 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf25Q9QZR0 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf25Q9QZR0 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf25Q9QZR0 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf25Q9QZR0 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf25Q9QZR0 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf25Q9QZR0 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf25Q9QZR0 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf25Q9QZR0 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf25Q9QZR0 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf25Q9QZR0 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf25Q9QZR0 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf25Q9QZR0 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf25Q9QZR0 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf25Q9QZR0 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf25Q9QZR0 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf25Q9QZR0 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf25Q9QZR0 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf25Q9QZR0 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf25Q9QZR0 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf25Q9QZR0 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf25Q9QZR0 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf25Q9QZR0 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf25Q9QZR0 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf25Q9QZR0 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf25Q9QZR0 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf25Q9QZR0 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf25Q9QZR0 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf25Q9QZR0 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf25Q9QZR0 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf25Q9QZR0 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf25Q9QZR0 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf25Q9QZR0 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf25Q9QZR0 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf25Q9QZR0 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf25Q9QZR0 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf25Q9QZR0 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf25Q9QZR0 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf25Q9QZR0 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf25Q9QZR0 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf25Q9QZR0 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf25Q9QZR0 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf25Q9QZR0 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf25Q9QZR0 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf25Q9QZR0 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf25Q9QZR0 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf25Q9QZR0 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf25Q9QZR0 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf25Q9QZR0 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf25Q9QZR0 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf25Q9QZR0 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf25Q9QZR0 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf25Q9QZR0 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf25Q9QZR0 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf25Q9QZR0 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf25Q9QZR0 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf25Q9QZR0 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf25Q9QZR0 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnf25Q9QZR0 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.5 ms