Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZM3

Clcf1, Cardiotrophin-like cytokine factor 1, mousemouse

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Length 225 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clcf1Q9QZM3 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Clcf1Q9QZM3 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Clcf1Q9QZM3 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Clcf1Q9QZM3 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Clcf1Q9QZM3 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Clcf1Q9QZM3 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Clcf1Q9QZM3 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Clcf1Q9QZM3 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Clcf1Q9QZM3 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Clcf1Q9QZM3 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Clcf1Q9QZM3 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Clcf1Q9QZM3 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Clcf1Q9QZM3 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Clcf1Q9QZM3 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Clcf1Q9QZM3 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Clcf1Q9QZM3 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Clcf1Q9QZM3 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Clcf1Q9QZM3 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Clcf1Q9QZM3 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Clcf1Q9QZM3 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Clcf1Q9QZM3 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Clcf1Q9QZM3 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Clcf1Q9QZM3 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Clcf1Q9QZM3 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Clcf1Q9QZM3 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Clcf1Q9QZM3 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
Clcf1Q9QZM3 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Clcf1Q9QZM3 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Clcf1Q9QZM3 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Clcf1Q9QZM3 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Clcf1Q9QZM3 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Clcf1Q9QZM3 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Clcf1Q9QZM3 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Clcf1Q9QZM3 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Clcf1Q9QZM3 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Clcf1Q9QZM3 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Clcf1Q9QZM3 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Clcf1Q9QZM3 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Clcf1Q9QZM3 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Clcf1Q9QZM3 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Clcf1Q9QZM3 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Clcf1Q9QZM3 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Clcf1Q9QZM3 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Clcf1Q9QZM3 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Clcf1Q9QZM3 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Clcf1Q9QZM3 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Clcf1Q9QZM3 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Clcf1Q9QZM3 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Clcf1Q9QZM3 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Clcf1Q9QZM3 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Clcf1Q9QZM3 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Clcf1Q9QZM3 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Clcf1Q9QZM3 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Clcf1Q9QZM3 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Clcf1Q9QZM3 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Clcf1Q9QZM3 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Clcf1Q9QZM3 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Clcf1Q9QZM3 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Clcf1Q9QZM3 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Clcf1Q9QZM3 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Clcf1Q9QZM3 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Clcf1Q9QZM3 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Clcf1Q9QZM3 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Clcf1Q9QZM3 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Clcf1Q9QZM3 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Clcf1Q9QZM3 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Clcf1Q9QZM3 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Clcf1Q9QZM3 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Clcf1Q9QZM3 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Clcf1Q9QZM3 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Clcf1Q9QZM3 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Clcf1Q9QZM3 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Clcf1Q9QZM3 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Clcf1Q9QZM3 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Clcf1Q9QZM3 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Clcf1Q9QZM3 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Clcf1Q9QZM3 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Clcf1Q9QZM3 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Clcf1Q9QZM3 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Clcf1Q9QZM3 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Clcf1Q9QZM3 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Clcf1Q9QZM3 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Clcf1Q9QZM3 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Clcf1Q9QZM3 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Clcf1Q9QZM3 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Clcf1Q9QZM3 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Clcf1Q9QZM3 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Clcf1Q9QZM3 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Clcf1Q9QZM3 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Clcf1Q9QZM3 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Clcf1Q9QZM3 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Clcf1Q9QZM3 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Clcf1Q9QZM3 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Clcf1Q9QZM3 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Clcf1Q9QZM3 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Clcf1Q9QZM3 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Clcf1Q9QZM3 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Clcf1Q9QZM3 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Clcf1Q9QZM3 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Clcf1Q9QZM3 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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