Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ09

Phtf1, Putative homeodomain transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 761 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phtf1Q9QZ09 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Phtf1Q9QZ09 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Phtf1Q9QZ09 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Phtf1Q9QZ09 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Phtf1Q9QZ09 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Phtf1Q9QZ09 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Phtf1Q9QZ09 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Phtf1Q9QZ09 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Phtf1Q9QZ09 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Phtf1Q9QZ09 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Phtf1Q9QZ09 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Phtf1Q9QZ09 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Phtf1Q9QZ09 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Phtf1Q9QZ09 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Phtf1Q9QZ09 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Phtf1Q9QZ09 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Phtf1Q9QZ09 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Phtf1Q9QZ09 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Phtf1Q9QZ09 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Phtf1Q9QZ09 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Phtf1Q9QZ09 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Phtf1Q9QZ09 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Phtf1Q9QZ09 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Phtf1Q9QZ09 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Phtf1Q9QZ09 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Phtf1Q9QZ09 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Phtf1Q9QZ09 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Phtf1Q9QZ09 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Phtf1Q9QZ09 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Phtf1Q9QZ09 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Phtf1Q9QZ09 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Phtf1Q9QZ09 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Phtf1Q9QZ09 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Phtf1Q9QZ09 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Phtf1Q9QZ09 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Phtf1Q9QZ09 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Phtf1Q9QZ09 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Phtf1Q9QZ09 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Phtf1Q9QZ09 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Phtf1Q9QZ09 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Phtf1Q9QZ09 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Phtf1Q9QZ09 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Phtf1Q9QZ09 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Phtf1Q9QZ09 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Phtf1Q9QZ09 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Phtf1Q9QZ09 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Phtf1Q9QZ09 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Phtf1Q9QZ09 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Phtf1Q9QZ09 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Phtf1Q9QZ09 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Phtf1Q9QZ09 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Phtf1Q9QZ09 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Phtf1Q9QZ09 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Phtf1Q9QZ09 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Phtf1Q9QZ09 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Phtf1Q9QZ09 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Phtf1Q9QZ09 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Phtf1Q9QZ09 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Phtf1Q9QZ09 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Phtf1Q9QZ09 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Phtf1Q9QZ09 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Phtf1Q9QZ09 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Phtf1Q9QZ09 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Phtf1Q9QZ09 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Phtf1Q9QZ09 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Phtf1Q9QZ09 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Phtf1Q9QZ09 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Phtf1Q9QZ09 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Phtf1Q9QZ09 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Phtf1Q9QZ09 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Phtf1Q9QZ09 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Phtf1Q9QZ09 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Phtf1Q9QZ09 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Phtf1Q9QZ09 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Phtf1Q9QZ09 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Phtf1Q9QZ09 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Phtf1Q9QZ09 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Phtf1Q9QZ09 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Phtf1Q9QZ09 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Phtf1Q9QZ09 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Phtf1Q9QZ09 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Phtf1Q9QZ09 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Phtf1Q9QZ09 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Phtf1Q9QZ09 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Phtf1Q9QZ09 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Phtf1Q9QZ09 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Phtf1Q9QZ09 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Phtf1Q9QZ09 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Phtf1Q9QZ09 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Phtf1Q9QZ09 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Phtf1Q9QZ09 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Phtf1Q9QZ09 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Phtf1Q9QZ09 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Phtf1Q9QZ09 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Phtf1Q9QZ09 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Phtf1Q9QZ09 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Phtf1Q9QZ09 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Phtf1Q9QZ09 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Phtf1Q9QZ09 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Phtf1Q9QZ09 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms