Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYA2

Tomm40, Mitochondrial import receptor subunit TOM40 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tomm40Q9QYA2 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tomm40Q9QYA2 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tomm40Q9QYA2 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tomm40Q9QYA2 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tomm40Q9QYA2 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tomm40Q9QYA2 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Tomm40Q9QYA2 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tomm40Q9QYA2 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Tomm40Q9QYA2 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tomm40Q9QYA2 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Tomm40Q9QYA2 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tomm40Q9QYA2 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tomm40Q9QYA2 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tomm40Q9QYA2 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tomm40Q9QYA2 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tomm40Q9QYA2 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tomm40Q9QYA2 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tomm40Q9QYA2 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tomm40Q9QYA2 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tomm40Q9QYA2 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tomm40Q9QYA2 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tomm40Q9QYA2 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tomm40Q9QYA2 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tomm40Q9QYA2 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tomm40Q9QYA2 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tomm40Q9QYA2 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tomm40Q9QYA2 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tomm40Q9QYA2 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tomm40Q9QYA2 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tomm40Q9QYA2 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tomm40Q9QYA2 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tomm40Q9QYA2 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tomm40Q9QYA2 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tomm40Q9QYA2 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tomm40Q9QYA2 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tomm40Q9QYA2 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Tomm40Q9QYA2 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tomm40Q9QYA2 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tomm40Q9QYA2 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tomm40Q9QYA2 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tomm40Q9QYA2 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tomm40Q9QYA2 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tomm40Q9QYA2 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tomm40Q9QYA2 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Tomm40Q9QYA2 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Tomm40Q9QYA2 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tomm40Q9QYA2 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tomm40Q9QYA2 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tomm40Q9QYA2 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tomm40Q9QYA2 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tomm40Q9QYA2 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tomm40Q9QYA2 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tomm40Q9QYA2 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tomm40Q9QYA2 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tomm40Q9QYA2 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tomm40Q9QYA2 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tomm40Q9QYA2 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tomm40Q9QYA2 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tomm40Q9QYA2 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tomm40Q9QYA2 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tomm40Q9QYA2 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tomm40Q9QYA2 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tomm40Q9QYA2 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tomm40Q9QYA2 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tomm40Q9QYA2 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tomm40Q9QYA2 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tomm40Q9QYA2 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tomm40Q9QYA2 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tomm40Q9QYA2 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tomm40Q9QYA2 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tomm40Q9QYA2 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tomm40Q9QYA2 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tomm40Q9QYA2 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tomm40Q9QYA2 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tomm40Q9QYA2 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tomm40Q9QYA2 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tomm40Q9QYA2 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tomm40Q9QYA2 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tomm40Q9QYA2 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tomm40Q9QYA2 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tomm40Q9QYA2 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tomm40Q9QYA2 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Tomm40Q9QYA2 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tomm40Q9QYA2 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tomm40Q9QYA2 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Tomm40Q9QYA2 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tomm40Q9QYA2 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Tomm40Q9QYA2 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tomm40Q9QYA2 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tomm40Q9QYA2 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Tomm40Q9QYA2 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tomm40Q9QYA2 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tomm40Q9QYA2 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tomm40Q9QYA2 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tomm40Q9QYA2 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tomm40Q9QYA2 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Tomm40Q9QYA2 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tomm40Q9QYA2 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tomm40Q9QYA2 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tomm40Q9QYA2 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.4 ms