Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY14

Foxe3, Forkhead box protein E3, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxe3Q9QY14 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Foxe3Q9QY14 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Foxe3Q9QY14 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Foxe3Q9QY14 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Foxe3Q9QY14 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Foxe3Q9QY14 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Foxe3Q9QY14 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Foxe3Q9QY14 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Foxe3Q9QY14 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Foxe3Q9QY14 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Foxe3Q9QY14 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Foxe3Q9QY14 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Foxe3Q9QY14 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Foxe3Q9QY14 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Foxe3Q9QY14 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Foxe3Q9QY14 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Foxe3Q9QY14 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Foxe3Q9QY14 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Foxe3Q9QY14 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Foxe3Q9QY14 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Foxe3Q9QY14 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Foxe3Q9QY14 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Foxe3Q9QY14 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Foxe3Q9QY14 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Foxe3Q9QY14 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Foxe3Q9QY14 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Foxe3Q9QY14 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Foxe3Q9QY14 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Foxe3Q9QY14 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Foxe3Q9QY14 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Foxe3Q9QY14 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Foxe3Q9QY14 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Foxe3Q9QY14 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Foxe3Q9QY14 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Foxe3Q9QY14 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Foxe3Q9QY14 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Foxe3Q9QY14 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Foxe3Q9QY14 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Foxe3Q9QY14 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Foxe3Q9QY14 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Foxe3Q9QY14 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Foxe3Q9QY14 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Foxe3Q9QY14 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Foxe3Q9QY14 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Foxe3Q9QY14 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Foxe3Q9QY14 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Foxe3Q9QY14 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Foxe3Q9QY14 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Foxe3Q9QY14 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Foxe3Q9QY14 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Foxe3Q9QY14 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Foxe3Q9QY14 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Foxe3Q9QY14 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Foxe3Q9QY14 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Foxe3Q9QY14 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Foxe3Q9QY14 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Foxe3Q9QY14 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Foxe3Q9QY14 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Foxe3Q9QY14 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Foxe3Q9QY14 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Foxe3Q9QY14 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Foxe3Q9QY14 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Foxe3Q9QY14 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Foxe3Q9QY14 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Foxe3Q9QY14 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Foxe3Q9QY14 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Foxe3Q9QY14 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Foxe3Q9QY14 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Foxe3Q9QY14 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Foxe3Q9QY14 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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Foxe3Q9QY14 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Foxe3Q9QY14 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Foxe3Q9QY14 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Foxe3Q9QY14 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Foxe3Q9QY14 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Foxe3Q9QY14 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Foxe3Q9QY14 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Foxe3Q9QY14 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Foxe3Q9QY14 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Foxe3Q9QY14 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Foxe3Q9QY14 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Foxe3Q9QY14 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Foxe3Q9QY14 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Foxe3Q9QY14 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Foxe3Q9QY14 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Foxe3Q9QY14 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Foxe3Q9QY14 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Foxe3Q9QY14 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Foxe3Q9QY14 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Foxe3Q9QY14 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Foxe3Q9QY14 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Foxe3Q9QY14 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Foxe3Q9QY14 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Foxe3Q9QY14 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Foxe3Q9QY14 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Foxe3Q9QY14 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Foxe3Q9QY14 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Foxe3Q9QY14 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Foxe3Q9QY14 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms